RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 FAM205CA6NFA0 338 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 CASP1P29466 404 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 BRD3Q15059 726 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 CDKAL1Q5VV42 579 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 ZNF654Q8IZM8 581 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 LCORLQ8N3X6 602 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 EPSTI1Q96J88 318 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 MAP2K7O14733 419 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 TDO2P48775 406 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 PAGE5Q96GU1 130 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 CDC23Q9UJX2 597 aa16.97■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 ERICH2A1L162 156 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 KIF5CO60282 957 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 PDE8AO60658 829 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 MFAP3LO75121 409 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 STARD3NLO95772 234 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 RASGRP2Q7LDG7 609 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 H3BQF6 201 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 SNAP23O00161 211 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 TMTC2Q8N394 836 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 CARD10Q9BWT7 1032 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 MROH5Q6ZUA9 1318 aa16.96■□□□□ 0.31
SYP-201ENST00000263233 LRP5O75197 1615 aa16.96■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa16.96■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 TRIM75PA6NK02 468 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 CASP14P31944 242 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 RCAN1P53805 252 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 GYS2P54840 703 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 ZNF569Q5MCW4 686 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 CEP112Q8N8E3 955 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 PIGBQ92521 554 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 MTA3Q9BTC8 594 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 BCORQ6W2J9 1755 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 CAPN2P17655 700 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 DPYDQ12882 1025 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 GPS2Q13227 327 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 CTAGE1Q96RT6 745 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 MYH6P13533 1939 aa16.95■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 GYPCP04921 128 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 SLC5A1P13866 664 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 GNAT2P19087 354 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 VPS54Q9P1Q0 977 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 SEMA3EO15041 775 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 FECHP22830 423 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 PKN1Q16512 942 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 GSDMAQ96QA5 445 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 PNKPQ96T60 521 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 RAB21Q9UL25 225 aa16.94■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 WNT7AO00755 349 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 USP5P45974 858 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 FILIP1LQ4L180 1135 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 ADAM21Q9UKJ8 722 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 ITIH6Q6UXX5 1313 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 SEC23AQ15436 765 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 CNGA4Q8IV77 575 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 SLC35F6Q8N357 371 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 EXOC4Q96A65 974 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.93■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 ABL1P00519 1130 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 KRT2P35908 639 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 PPARAQ07869 468 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 CCDC51Q96ER9 411 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 UBAC1Q9BSL1 405 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 TNKSO95271 1327 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 CTAGE9A4FU28 777 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 POTEB2H3BUK9 544 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 COBLO75128 1261 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 PRDM1O75626 825 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 ERVK-24P63145 666 aa16.92■□□□□ 0.3
SYP-201ENST00000263233 TUBB2AQ13885 445 aa16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms