RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 NF2P35240 595 aa12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 SLC4A3P48751 1232 aa12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 AK2P54819 239 aa12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 TSGA10IPQ3SY00 556 aa12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 RCSD1Q6JBY9 416 aa12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 UBAC1Q9BSL1 405 aa12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 ZNF341Q9BYN7 854 aa12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 CLIP2Q9UDT6 1046 aa12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 EEF2P13639 858 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 MCM5P33992 734 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 TMEM67Q5HYA8 995 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 SMC1BQ8NDV3 1235 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 KRT23Q9C075 422 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 CPVLQ9H3G5 476 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 PDRG1Q9NUG6 133 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 SWAP70Q9UH65 585 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 ZHX2Q9Y6X8 837 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 MAP3K10Q02779 954 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 ICA1Q05084 483 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 DCAF15Q66K64 600 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 CNNM2Q9H8M5 875 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 BRPF3Q9ULD4 1205 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 PASKQ96RG2 1323 aa12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 TBC1D12O60347 775 aa12.77□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 HUNKP57058 714 aa12.77□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 KRT32Q14532 448 aa12.77□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 MICU3Q86XE3 530 aa12.77□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 CCDC82Q8N4S0 544 aa12.77□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 MTMR4Q9NYA4 1195 aa12.77□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
TTPA-201ENST00000260116 IRF6O14896 467 aa12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 GOLGA8HP0CJ92 632 aa12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 PTPRAP18433 802 aa12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 ANAPC15P60006 121 aa12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 SPP2Q13103 211 aa12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 IQCA1Q86XH1 822 aa12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 LY9Q9HBG7 655 aa12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 ATAD5Q96QE3 1844 aa12.77□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 PSMA5P28066 241 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 CCT2P78371 535 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 MTMR2Q13614 643 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 SCYL3Q8IZE3 742 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 NECAB1Q8N987 351 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 NEDD1Q8NHV4 660 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 NUP133Q8WUM0 1156 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 TTC14Q96N46 770 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 ZNF287Q9HBT7 754 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 CABP5Q9NP86 173 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 TPCN1Q9ULQ1 816 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 GJA5P36382 358 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 IREB2P48200 963 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 MAP3K9P80192 1104 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 SEC23AQ15436 765 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 NFXL1Q6ZNB6 911 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 SAPCD2Q86UD0 394 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 OPTNQ96CV9 577 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 ZIC5Q96T25 663 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 TMEM47Q9BQJ4 181 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 PICK1Q9NRD5 415 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 ZNF112Q9UJU3 913 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 CSADQ9Y600 493 aa12.76□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 ASNSP08243 561 aa12.75□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 WTAPQ15007 396 aa12.75□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 TMEM179Q6ZVK1 233 aa12.75□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 C2orf69Q8N8R5 385 aa12.75□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 PIBF1Q8WXW3 757 aa12.75□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa12.74□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 HMGCS2P54868 508 aa12.74□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 USP17L2Q6R6M4 530 aa12.74□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 ARMC9Q7Z3E5 817 aa12.74□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa12.74□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 FEZ1Q99689 392 aa12.74□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 MYH4Q9Y623 1939 aa12.74□□□□□ -0.37
TTPA-201ENST00000260116 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms