RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TEX11Q8IYF3 940 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 CMA1P23946 247 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TMED1Q13445 227 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 SRLQ86TD4 932 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TRIML1Q8N9V2 468 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 LINS1Q8NG48 757 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TMEM87BQ96K49 555 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TSPY3P0CV98 308 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TSPY8P0CW00 308 aa17.75■□□□□ 0.43
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CTIF-201ENST00000256413 ALS2CLQ60I27 953 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 CCDC13Q8IYE1 715 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
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CTIF-201ENST00000256413 AMFRQ9UKV5 643 aa17.74■□□□□ 0.43
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CTIF-201ENST00000256413 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
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CTIF-201ENST00000256413 ADAMTS2O95450 1211 aa17.74■□□□□ 0.43
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CTIF-201ENST00000256413 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.43
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CTIF-201ENST00000256413 PCDHA7Q9UN72 937 aa17.74■□□□□ 0.43
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CTIF-201ENST00000256413 STMN1P16949 149 aa17.73■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 WHAMMQ8TF30 809 aa17.73■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 IKBKBO14920 756 aa17.73■□□□□ 0.43
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CTIF-201ENST00000256413 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
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CTIF-201ENST00000256413 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa17.73■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TTC38Q5R3I4 469 aa17.73■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
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CTIF-201ENST00000256413 TEX2Q8IWB9 1127 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TPCN1Q9ULQ1 816 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 CUL4AQ13619 759 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 SLF2Q8IX21 1173 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 KLHDC4Q8TBB5 520 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 HAUS1Q96CS2 278 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 VPS37BQ9H9H4 285 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 BUB1O43683 1085 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 XAGE3Q8WTP9 111 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 IMPG2Q9BZV3 1241 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 POLKQ9UBT6 870 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 RANBP1P43487 201 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 GPTP24298 496 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 CASP14P31944 242 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 ITIH3Q06033 890 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 SPDL1Q96EA4 605 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 BLZF1Q9H2G9 400 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 YY1AP1Q9H869 796 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 KRT12Q99456 494 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 TACC3Q9Y6A5 838 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 MAIP1Q8WWC4 291 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 KIFAP3Q92845 792 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 NLRC4Q9NPP4 1024 aa17.71■□□□□ 0.43
CTIF-201ENST00000256413 NOS1P29475 1434 aa17.71■□□□□ 0.42
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PQ27 194 aa17.7■□□□□ 0.42
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PQ64 194 aa17.7■□□□□ 0.42
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PQD8 194 aa17.7■□□□□ 0.42
CTIF-201ENST00000256413 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
CTIF-201ENST00000256413 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa17.7■□□□□ 0.42
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