RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 VEGFBP49765 207 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP1BP68106 108 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ME3Q16798 604 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCK5Q3MIX3 580 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CREB3L3Q68CJ9 461 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-201ENST00000246533 LDLRAD1Q5T700 205 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMC9Q7Z3E5 817 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 KLRG1Q96E93 195 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 OTOFQ9HC10 1997 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZIC5Q96T25 663 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP62CLQ9H1M0 184 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CAVIN2O95810 425 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCD1P51178 756 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2D6P10635 497 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 INPP5BP32019 993 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TSGA10IPQ3SY00 556 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CERS3Q8IU89 383 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 RGMBQ6NW40 437 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP30.55■■■□□ 2.488e-20■■□□□ 14.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC18Q9H819 358 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CPA1P15085 419 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPNS2Q96L46 248 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 MCM9Q9NXL9 1143 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 GSG1L2A8MUP6 293 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 AOC2O75106 756 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ST3GAL1Q11201 340 aa30.53■■■□□ 2.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 NAV1Q8NEY1 1877 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXP2O15409 715 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 IREB2P48200 963 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TPCN1Q9ULQ1 816 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF20L1A8MW92 1017 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K10Q02779 954 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 VGLL4Q14135 290 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC27A2O14975 620 aa30.51■■■□□ 2.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF341Q9BYN7 854 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-201ENST00000246533 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRT32Q14532 448 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC6Q86TZ1 520 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HHIPL1Q96JK4 782 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ELP3Q9H9T3 547 aa30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K9P80192 1104 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TYRO3Q06418 890 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 RASAL3Q86YV0 1011 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF112Q9UJU3 913 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS6KB1P23443 525 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L12C9JPN9 530 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L21D6R901 530 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCB2Q00722 1185 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HOOK2Q96ED9 719 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TNMDQ9H2S6 317 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNF1Q9H3M0 494 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HELLSQ9NRZ9 838 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 MRVI1Q9Y6F6 885 aa30.48■■■□□ 2.47
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CAPNS1-201ENST00000246533 AP5Z1O43299 807 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 GJA5P36382 358 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CTR9Q6PD62 1173 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC10A4Q96EP9 437 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNLL2Q96FJ2 89 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 APPP05067 770 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 JAG1P78504 1218 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D12O60347 775 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC10A3P09131 477 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
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