RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZHX2Q9Y6X8 837 aa10.8□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 USP17L5A8MUK1 530 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC27A2O14975 620 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 NOGQ13253 232 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM47AQ5JRC9 791 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 TOMM22Q9NS69 142 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 KCNH4Q9UQ05 1017 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 PARP14Q460N5 1801 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRIM75PA6NK02 468 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSPY2A6NKD2 308 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSPY3P0CV98 308 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSPY8P0CW00 308 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 ICA1Q05084 483 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 STOX1Q6ZVD7 989 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF280CQ8ND82 737 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 AS3MTQ9HBK9 375 aa10.79□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 B4E1Z4 1266 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 E7EWF7 191 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 TFAP4Q01664 338 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPP2Q13103 211 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 DGKZQ13574 1117 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 MTMR2Q13614 643 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 NEDD1Q8NHV4 660 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 IL17RAQ96F46 866 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 WDR18Q9BV38 432 aa10.78□□□□□ -0.68
PRAMEF10-201ENST00000235347 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 A0A1W2PRG0 241 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 CXCL11O14625 94 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 NMT2O60551 498 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 KDM4AO75164 1064 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 HSPA4P34932 840 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 GTF2A2P52657 109 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 SNAPC2Q13487 334 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 SIAH1Q8IUQ4 282 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 ACER1Q8TDN7 264 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 ESR2Q92731 530 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 CEP95Q96GE4 821 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 CNNM2Q9H8M5 875 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 KANSL2Q9H9L4 492 aa10.77□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 EEF2P13639 858 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 MAP2K2P36507 400 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 HMGCS2P54868 508 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 MOGSQ13724 837 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCL15Q16663 113 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 RNF20Q5VTR2 975 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 RASEFQ8IZ41 740 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 BRI3BPQ8WY22 251 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 KCNB2Q92953 911 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 FEZ1Q99689 392 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 KRT23Q9C075 422 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 IL17RBQ9NRM6 502 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 MTMR4Q9NYA4 1195 aa10.76□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 RLFQ13129 1914 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 A0A0G2JMZ2 1700 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 USP17L10C9JJH3 530 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 CETPP11597 493 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 NT5C2P49902 561 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 BACE1P56817 501 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATP2B2Q01814 1243 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 SREBF2Q12772 1141 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRDNQ13061 729 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 CLEC17AQ6ZS10 378 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYB5R4Q7L1T6 521 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 NCOA7Q8NI08 942 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 NYAP2Q9P242 653 aa10.75□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 C19orf81C9J6K1 198 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 TM4SF4P48230 202 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 NOVP48745 357 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 ADCK5Q3MIX3 580 aa10.74□□□□□ -0.69
PRAMEF10-201ENST00000235347 TSGA10IPQ3SY00 556 aa10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms