RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 NELFBQ8WX92 580 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CD2APQ9Y5K6 639 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP25P42331 645 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 EVCP57679 992 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PPFIA1Q13136 1202 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CFAP221Q4G0U5 840 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 TSPYL6Q8N831 410 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CHURC1Q8WUH1 139 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 BTG4Q9NY30 223 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 ZMYM6O95789 1325 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 SEMA3EO15041 775 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 SH3BP5O60239 455 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 GNPTABQ3T906 1256 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 LMNTD2Q8IXW0 634 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 MICALL1Q8N3F8 863 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PPFIA4O75335 1185 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 RHOXF2BP0C7M4 288 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 ATP2B4P23634 1241 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 TMC4Q7Z404 712 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CCDC25Q86WR0 208 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 NIM1KQ8IY84 436 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 BBOF1Q8ND07 529 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 VCX3BQ9H321 246 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CEP170Q5SW79 1584 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 LAD1O00515 517 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CCDC62Q6P9F0 684 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 FAM81BQ96LP2 452 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 NOD1Q9Y239 953 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 DISP1Q96F81 1524 aa8□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GUA9 196 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PHBP35232 272 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PPARAQ07869 468 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CEP85LQ5SZL2 805 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 HAUS1Q96CS2 278 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 SLC1A4P43007 532 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 IRX4P78413 519 aa7.99□□□□□ -1.13
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CPS1-201ENST00000233072 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.99□□□□□ -1.13
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CPS1-201ENST00000233072 CHST3Q7LGC8 479 aa7.99□□□□□ -1.13
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CPS1-201ENST00000233072 CSRNP1Q96S65 589 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 USP19O94966 1318 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 GIPC1O14908 333 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CTSWP56202 376 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 MYCT1Q8N699 235 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 ABCC4O15439 1325 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.99□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CHMP2AO43633 222 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 KRT9P35527 623 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 TXKP42681 527 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 SUCLG2Q96I99 432 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 CUEDC2Q9H467 287 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PTPRTO14522 1441 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PPFIA3O75145 1194 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 DCAF15Q66K64 600 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.98□□□□□ -1.13
CPS1-201ENST00000233072 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.98□□□□□ -1.13
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