RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmod2Q9JKK7 351 aa13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtmr3Q8K296 1196 aa13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dpp7Q9ET22 506 aa13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tpd52l1O54818 204 aa13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 ImpactO55091 318 aa13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rps12P63323 132 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cnot7Q60809 285 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slitrk3Q810B9 980 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shtn1Q8K2Q9 631 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef6Q8K4I3 771 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col5a2Q3U962 1497 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 CebpaP53566 359 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 MthfslL7N466 203 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klrg2Q3UM83 387 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kctd1Q5M956 257 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpatch3Q8BIY1 525 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stk32bQ9JJX8 414 aa13.55□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pagr1bF6V0H0 108 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdm4aQ8BW72 1064 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plcd3Q8K2J0 785 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Glis2Q8VDL9 521 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trex1Q91XB0 314 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pagr1aQ99L02 253 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh13B1AR69 1938 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc112A0AUP1 442 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd22P35329 862 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gxylt1Q3UHH8 404 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hip1rQ9JKY5 1068 aa13.54□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm21969J3QJZ1 289 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lnx1O70263 728 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mx1P09922 631 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prkg1P0C605 671 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oog3Q3UWY1 500 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdan1Q8CC12 1239 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tgm5Q9D7I9 724 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sall1Q9ER74 1322 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dcdc2bF7BCK0 340 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lgr6Q3UVD5 967 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Senp6Q6P7W0 1132 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klrc1Q9Z202 244 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kif3aP28741 701 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lzts2Q91YU6 671 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Med4Q9CQA5 270 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppil2Q9D787 521 aa13.53□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phrf1A6H619 1682 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Syce3B5KM66 88 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp3a25O09158 503 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Oxr1Q4KMM3 866 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myo19Q5SV80 963 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim29Q8R2Q0 587 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem79Q9D709 391 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Styxl1Q9DAR2 321 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prkab1Q9R078 270 aa13.52□□□□□ -0.24
Herc3-201ENSMUST00000031823 Palm3A2TJV2 734 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm28047Q3US59 414 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 OplahQ8K010 1288 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ampd3O08739 766 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q3UJP5 209 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr3gQ6NXY9 223 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ascc2Q91WR3 749 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Etnk1Q9D4V0 363 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 CsadQ9DBE0 493 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clic4Q9QYB1 253 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acot3Q9QYR7 432 aa13.52□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chd5A2A8L1 1946 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nap1l2P51860 460 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sema3eP70275 775 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Epha10Q8BYG9 1007 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Riox2Q8CD15 465 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp26c1B2RXA7 518 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prr7Q3V0I2 269 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nsrp1Q5NCR9 542 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stxbp2Q64324 593 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trim11Q99PQ2 467 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppef2O35385 757 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arhgef2Q60875 985 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gbp7Q91Z40 638 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms