RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113312.8

Shq1-202, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 6,816 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-202ENSMUST00000113312 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm10272F7CZ33 110 aa6.46□□□□□ -1.37
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah10D3YYQ8 4591 aa6.45□□□□□ -1.38
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sprr2iO70560 76 aa6.44□□□□□ -1.38
Shq1-202ENSMUST00000113312 CubnQ9JLB4 3623 aa6.43□□□□□ -1.38
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1jD3YUU5 139 aa6.38□□□□□ -1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1gQ9D195 139 aa6.38□□□□□ -1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1iQ9D6P5 149 aa6.38□□□□□ -1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1hQ9D6R3 140 aa6.38□□□□□ -1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap9-5A2A5X3 358 aa6.37□□□□□ -1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce3eF8VQJ0 98 aa6.36□□□□□ -1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce3fQ6PAI4 98 aa6.36□□□□□ -1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sprr2fO70557 76 aa6.34□□□□□ -1.39
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce3dE9Q8V1 98 aa6.31□□□□□ -1.4
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm10100J3QK64 120 aa6.31□□□□□ -1.4
Shq1-202ENSMUST00000113312 BsnO88737 3942 aa6.24□□□□□ -1.41
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah5Q8VHE6 4621 aa6.19□□□□□ -1.42
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce3aQ497I5 98 aa6.17□□□□□ -1.42
Shq1-202ENSMUST00000113312 Xirp2Q4U4S6 3784 aa6.15□□□□□ -1.42
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm10142J3KMP7 120 aa6.13□□□□□ -1.43
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap19-3Q925H6 87 aa6.12□□□□□ -1.43
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa6.07□□□□□ -1.44
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sprr2eO70556 76 aa6.06□□□□□ -1.44
Shq1-202ENSMUST00000113312 Vps13dB1ART2 4390 aa6.03□□□□□ -1.44
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1bQ9D149 137 aa6.01□□□□□ -1.45
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1fB9EJP6 147 aa5.99□□□□□ -1.45
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1cQ9D1C5 147 aa5.99□□□□□ -1.45
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1lQ9D1G7 135 aa5.99□□□□□ -1.45
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1dQ9D731 133 aa5.99□□□□□ -1.45
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah2P0C6F1 4456 aa5.98□□□□□ -1.45
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm10024A0A0A0MQA4 119 aa5.97□□□□□ -1.45
Shq1-202ENSMUST00000113312 Stard9Q80TF6 4561 aa5.95□□□□□ -1.46
Shq1-202ENSMUST00000113312 TnxbO35452 4006 aa5.95□□□□□ -1.46
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap22-2J3QNX6 67 aa5.94□□□□□ -1.46
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mt2P02798 61 aa5.9□□□□□ -1.46
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah11E9Q7N9 4488 aa5.9□□□□□ -1.46
Shq1-202ENSMUST00000113312 ApobE9Q414 4505 aa5.9□□□□□ -1.47
Shq1-202ENSMUST00000113312 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa5.89□□□□□ -1.47
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1eQ9D139 143 aa5.87□□□□□ -1.47
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa5.86□□□□□ -1.47
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah6E9Q0B6 4144 aa5.85□□□□□ -1.47
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah17Q69Z23 4481 aa5.82□□□□□ -1.48
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah1E9Q8T7 4250 aa5.81□□□□□ -1.48
Shq1-202ENSMUST00000113312 Kmt2aP55200 3966 aa5.78□□□□□ -1.48
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dync2h1Q45VK7 4306 aa5.77□□□□□ -1.49
Shq1-202ENSMUST00000113312 Prm1P02319 51 aa5.77□□□□□ -1.49
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah3Q8BW94 4083 aa5.76□□□□□ -1.49
Shq1-202ENSMUST00000113312 PrkdcP97313 4128 aa5.73□□□□□ -1.49
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mt4P47945 62 aa5.72□□□□□ -1.49
Shq1-202ENSMUST00000113312 SacsQ9JLC8 4582 aa5.71□□□□□ -1.5
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah9B1AR51 4484 aa5.71□□□□□ -1.5
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap19-2Q925I0 141 aa5.67□□□□□ -1.5
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm11569B1AQB1 180 aa5.63□□□□□ -1.51
Shq1-202ENSMUST00000113312 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa5.62□□□□□ -1.51
Shq1-202ENSMUST00000113312 Vps13bQ80TY5 3993 aa5.62□□□□□ -1.51
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap4-2B1AQ85 167 aa5.6□□□□□ -1.51
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa5.59□□□□□ -1.51
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap19-1Q925H2 87 aa5.58□□□□□ -1.52
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah7aE9Q0T8 4024 aa5.54□□□□□ -1.52
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap1-3A2A588 173 aa5.54□□□□□ -1.52
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm7735D3YX18 52 aa5.54□□□□□ -1.52
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap19-4Q925H7 84 aa5.53□□□□□ -1.52
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pkd1O08852 4293 aa5.51□□□□□ -1.53
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lrp1bQ9JI18 4599 aa5.51□□□□□ -1.53
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fras1Q80T14 4010 aa5.49□□□□□ -1.53
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa5.46□□□□□ -1.54
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm10061D3Z714 54 aa5.41□□□□□ -1.54
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sprr2hO70559 108 aa5.36□□□□□ -1.55
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm9789Q8BIG3 52 aa5.35□□□□□ -1.55
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sprr2dO70555 85 aa5.3□□□□□ -1.56
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa5.29□□□□□ -1.56
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ryr1E9PZQ0 5035 aa5.28□□□□□ -1.56
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fat3Q8BNA6 4555 aa5.25□□□□□ -1.57
Shq1-202ENSMUST00000113312 Fat2Q5F226 4351 aa5.24□□□□□ -1.57
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnah8Q91XQ0 4731 aa5.24□□□□□ -1.57
Shq1-202ENSMUST00000113312 Hectd4E9Q2E4 4418 aa5.23□□□□□ -1.57
Shq1-202ENSMUST00000113312 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa5.21□□□□□ -1.58
Shq1-202ENSMUST00000113312 2300003K06RikA2A4M0 262 aa5.17□□□□□ -1.58
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa5.16□□□□□ -1.58
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap4-7Q9D732 168 aa5.12□□□□□ -1.59
Shq1-202ENSMUST00000113312 Pkhd1E9PZ36 4059 aa5.11□□□□□ -1.59
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm11596B1AQB0 205 aa5.1□□□□□ -1.59
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm11564A2A4L9 201 aa5.05□□□□□ -1.6
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm11563B1AQ90 168 aa5.05□□□□□ -1.6
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm11595B1AQA7 289 aa5.05□□□□□ -1.6
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap4-8B1AQA8 209 aa5.05□□□□□ -1.6
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap4-9B1AQA9 244 aa5.03□□□□□ -1.6
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa4.98□□□□□ -1.61
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1a1Q9CQH5 143 aa4.96□□□□□ -1.62
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1a2Q9D1K4 149 aa4.96□□□□□ -1.62
Shq1-202ENSMUST00000113312 Sprr2bO70554 98 aa4.94□□□□□ -1.62
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lrp2A2ARV4 4660 aa4.94□□□□□ -1.62
Shq1-202ENSMUST00000113312 Krtap31-1Q9D644 177 aa4.94□□□□□ -1.62
Shq1-202ENSMUST00000113312 Gm11562A0PK51 136 aa4.91□□□□□ -1.62
Shq1-202ENSMUST00000113312 Lce1kJ3QP15 125 aa4.91□□□□□ -1.62
Shq1-202ENSMUST00000113312 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
Shq1-202ENSMUST00000113312 Herc2Q4U2R1 4836 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.5 ms