RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGCRP04035 888 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX11Q8IYF3 940 aa29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX10O60683 326 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR18Q9BV38 432 aa29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRA1Q86SQ6 560 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 SIRT2Q8IXJ6 389 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 LRCH3Q96II8 777 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 POTEEQ6S8J3 1075 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 NECAB2Q7Z6G3 386 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKLE1Q8NAG6 615 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIB2Q92519 343 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GDF15Q99988 308 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 MAST2Q6P0Q8 1798 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 FOCADQ5VW36 1801 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.293e-8■■□□□ 13.7
CAPNS1-216ENST00000628306 MTMR2Q13614 643 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP85Q6P2H3 762 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PI4KBQ9UBF8 816 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 RPTORQ8N122 1335 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP4CP60510 307 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GORABQ5T7V8 394 aa29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 HMMRO75330 724 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 BACE1P56817 501 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAH12Q6ZR08 3092 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 DCTPP1Q9H773 170 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRKQ9NRH2 765 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 AS3MTQ9HBK9 375 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FLT1P17948 1338 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 BMP8BP34820 402 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ASNSP08243 561 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.288e-8■■■■□ 23.7
CAPNS1-216ENST00000628306 POLA2Q14181 598 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 C7orf61Q8IZ16 206 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 DBNDD2Q9BQY9 259 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 RBPJLQ9UBG7 517 aa29.29■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 HERVK_113P62684 666 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP8B2P98198 1209 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 USP6NLQ92738 828 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR108Q9NPR9 543 aa29.28■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2B6P20813 491 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 NUCB1Q02818 461 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 Q3C1V9 767 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 NBPF3Q9H094 633 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 PFASO15067 1338 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TNNI3KQ59H18 835 aa29.26■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 PALD1Q9ULE6 856 aa29.26■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.26■■■□□ 2.28
CAPNS1-216ENST00000628306 GDF11O95390 407 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf81C9J6K1 198 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 BAG3O95817 575 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PORCNQ9H237 461 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCG2P16885 1265 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SSH3Q8TE77 659 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TMOD4Q9NZQ9 345 aa29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L10C9JJH3 530 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 COL6A1P12109 1028 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ZAP70P43403 619 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 MORN1Q5T089 497 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SOCS4Q8WXH5 440 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 GINM1Q9NU53 330 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 SYN1P17600 705 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVK-9P63128 1117 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVK-24P63145 666 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
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