RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624444.1

CU633967.1-211, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CU633967.1, Length 7,628 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-211ENST00000624444 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 EFCC1Q9HA90 598 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 SMARCA4P51532 1647 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 GRM8O00222 908 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 CASC4Q6P4E1 433 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 ARHGAP6O43182 974 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 VAMP4O75379 141 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 SERPINB6P35237 376 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 TRIM14Q14142 442 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.59□□□□□ -1.35
CU633967.1-211ENST00000624444 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 SNX16P57768 344 aa6.59□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.59□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.59□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 NOS1P29475 1434 aa6.59□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 PFKFB1P16118 471 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 RASSF2P50749 326 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 ME3Q16798 604 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 RNF34Q969K3 372 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 PALD1Q9ULE6 856 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 IL16Q14005 1332 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 RNF40O75150 1001 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 TRPA1O75762 1119 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 PRR16Q569H4 304 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 TTC38Q5R3I4 469 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 PEX26Q7Z412 305 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 TCP11Q8WWU5 503 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 KRT12Q99456 494 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 POLD1P28340 1107 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 RCN2Q14257 317 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 BRD3Q15059 726 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 GDAP1Q8TB36 358 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 KRT40Q6A162 431 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 SLF2Q8IX21 1173 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 USP28Q96RU2 1077 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 MTMR3Q13615 1198 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 ABCC5O15440 1437 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 KRIT1O00522 736 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 GAS8O95995 478 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 LDHCP07864 332 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 SAT1P21673 171 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 TUBB4BP68371 445 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 GSTO1P78417 241 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 TMTC2Q8N394 836 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 CLIC4Q9Y696 253 aa6.58□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 KCNJ18B7U540 433 aa6.57□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 TIMM10P62072 90 aa6.57□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 KCNJ12Q14500 433 aa6.57□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 KSR2Q6VAB6 950 aa6.57□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.57□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 CABP7Q86V35 215 aa6.57□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 SPDL1Q96EA4 605 aa6.57□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CU633967.1-211ENST00000624444 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms