RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621161.4

RAB11FIP4-211, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 8,628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PDE6AP16499 860 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PDXDC1Q6P996 788 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HOMER3Q9NSC5 361 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CTAGE3PQ8IX95 158 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CDK19Q9BWU1 502 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PALM2Q8IXS6 379 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.92■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SLC4A1P02730 911 aa21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SNCBQ16143 134 aa21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KRT71Q3SY84 523 aa21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IQUBQ8NA54 791 aa21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CNNM4Q6P4Q7 775 aa21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TRIM63Q969Q1 353 aa21.91■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PTPRCP08575 1304 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TRAF5O00463 557 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 EFHD1Q9BUP0 239 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CASP2P42575 452 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SCYL1Q96KG9 808 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NUP58Q9BVL2 599 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 VPS37BQ9H9H4 285 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NPR1P16066 1061 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 STRN3Q13033 797 aa21.9■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SV2BQ7L1I2 683 aa21.89■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.89■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.89■■□□□ 1.1
RAB11FIP4-211ENST00000621161 C16orf87Q6PH81 154 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NBPF3Q9H094 633 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ST5P78524 1137 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 STX17P56962 302 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CLTAP09496 248 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BCRP11274 1271 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 EXOC7Q9UPT5 735 aa21.89■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HDAC11Q96DB2 347 aa21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FLCNQ8NFG4 579 aa21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KRT8P05787 483 aa21.88■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SKIP12755 728 aa21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FLOT1O75955 427 aa21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 S100BP04271 92 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZBBXA8MT70 800 aa21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 H0YC42 278 aa21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FBXO41Q8TF61 875 aa21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NOD1Q9Y239 953 aa21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ABCC11Q96J66 1382 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PPP2R5AQ15172 486 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RAD50Q92878 1312 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 OATP04181 439 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KRT82Q9NSB4 513 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 PPP2R5EQ16537 467 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 NCOA1Q15788 1441 aa21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 EFCAB14O75071 495 aa21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 BRAPQ7Z569 592 aa21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LPXNO60711 386 aa21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 KRT75O95678 551 aa21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 LMNB1P20700 586 aa21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4-211ENST00000621161 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms