RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 UBR1Q8IWV7 1749 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 SYNMO15061 1565 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 UGGT1Q9NYU2 1555 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 ENC1O14682 589 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 WISP1O95388 367 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 PROCP04070 461 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 IREB2P48200 963 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 FANCCQ00597 558 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 SULF2Q8IWU5 870 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 UBASH3BQ8TF42 649 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYOM2P54296 1465 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 RALGAPBQ86X10 1494 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 PTPRTO14522 1441 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 H2AFB2P0C5Z0 115 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLFN14P0C7P3 912 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 PWP1Q13610 501 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPAT2Q6NUI2 795 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 FDX2Q6P4F2 183 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 HS2ST1Q7LGA3 356 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDZD3Q86UT5 571 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC51AQ86UW1 340 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 RELL1Q8IUW5 271 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 RSRP1Q9BUV0 290 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 ADAMTSL3P82987 1691 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 QRICH2Q9H0J4 1663 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 SART1O43290 800 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM37O94972 964 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 TIAF1O95411 115 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 GLB1P16278 677 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 BMP6P22004 513 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 MEI1Q5TIA1 1274 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 NT5DC4Q86YG4 428 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 C8orf37Q96NL8 207 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 TGIF2Q9GZN2 237 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 GGT7Q9UJ14 662 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD39.4-201ENST00000620099 AOC2O75106 756 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 ALX3O95076 343 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 DLGAP3O95886 979 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDE3AQ14432 1141 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 C9orf131Q5VYM1 1079 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 PCNX4Q63HM2 1172 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 AFAP1Q8N556 730 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 MEGF10Q96KG7 1140 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAD18Q9NS91 495 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 YEATS2Q9ULM3 1422 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 ITSN1Q15811 1721 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 FBXO24O75426 580 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 CELA3AP09093 270 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 NOS1P29475 1434 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 NPATQ14207 1427 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 AGMOQ6ZNB7 445 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 USP48Q86UV5 1035 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF654Q8IZM8 581 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 MYRFLQ96LU7 910 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 WDR18Q9BV38 432 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 YIPF2Q9BWQ6 316 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 ERVK-7P63135 1459 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 PLA2R1Q13018 1463 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 DIP2AQ14689 1571 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD39.4-201ENST00000620099 KIF3BO15066 747 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms