RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 KRT23Q9C075 422 aa17.45■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CNNM2Q9H8M5 875 aa17.45■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 TSPY2A6NKD2 308 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 KDM4AO75164 1064 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 GH2P01242 217 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 TSPY3P0CV98 308 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 TSPY8P0CW00 308 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 PCP11498 1178 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CAP2P40123 477 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 JAG1P78504 1218 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 KRT32Q14532 448 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 NCOA7Q8NI08 942 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ESR2Q92731 530 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CABP5Q9NP86 173 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF112Q9UJU3 913 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CSADQ9Y600 493 aa17.44■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 FGRP09769 529 aa17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 FKBP1BP68106 108 aa17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 RAB3GAP1Q15042 981 aa17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ADCK5Q3MIX3 580 aa17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 KCNB2Q92953 911 aa17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CLMNQ96JQ2 1002 aa17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC17Q96LX7 622 aa17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 NEK1Q96PY6 1258 aa17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 PICK1Q9NRD5 415 aa17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 HUNKP57058 714 aa17.42■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 VGLL4Q14135 290 aa17.42■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 TSGA10IPQ3SY00 556 aa17.42■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CHST3Q7LGC8 479 aa17.42■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa17.42■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 SCYL3Q8IZE3 742 aa17.42■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ELP3Q9H9T3 547 aa17.42■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 TMEM88BA6NKF7 163 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CPA1P15085 419 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ATP2B2Q01814 1243 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 SEPT2Q15019 361 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 MAP3K11Q16584 847 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CLEC10AQ8IUN9 316 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 SLC10A4Q96EP9 437 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ZSWIM5Q9P217 1185 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 SIPA1L1O43166 1804 aa17.41■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 NMT2O60551 498 aa17.4■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 ASNSP08243 561 aa17.4■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 CASTP20810 708 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 PSMA5P28066 241 aa17.4■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 LDLRAD1Q5T700 205 aa17.4■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 TMEM179Q6ZVK1 233 aa17.4■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 NEDD1Q8NHV4 660 aa17.4■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa17.4■□□□□ 0.38
NPIPB11-202ENST00000614927 LAMB1P07942 1786 aa17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 PRC1O43663 620 aa17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 GUCY1A2P33402 732 aa17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 MCM5P33992 734 aa17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 ANAPC15P60006 121 aa17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 TCEANC2Q96MN5 208 aa17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 TBC1D32Q96NH3 1257 aa17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 UBAC1Q9BSL1 405 aa17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 USP17L5A8MUK1 530 aa17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 PTPRAP18433 802 aa17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 RBM25P49756 843 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 APLP1P51693 650 aa17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 SAPCD2Q86UD0 394 aa17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 IQCA1Q86XH1 822 aa17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 LRRC2Q9BYS8 371 aa17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 KANSL2Q9H9L4 492 aa17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 ZHX2Q9Y6X8 837 aa17.38■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 ANTXR2P58335 489 aa17.37■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 FGD1P98174 961 aa17.37■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 ICA1Q05084 483 aa17.37■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 OTUD5Q96G74 571 aa17.37■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 CEP95Q96GE4 821 aa17.37■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 IL17RBQ9NRM6 502 aa17.37■□□□□ 0.37
NPIPB11-202ENST00000614927 GINM1Q9NU53 330 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms