RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa12.22□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 VGLL2Q8N8G2 317 aa12.22□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 JMYQ8N9B5 988 aa12.22□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 SDR42E1Q8WUS8 393 aa12.22□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 MPHOSPH8Q99549 860 aa12.22□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.22□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa12.22□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa12.22□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 SART3Q15020 963 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa12.21□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 MFSD6Q6ZSS7 791 aa12.21□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 SERTAD1Q9UHV2 236 aa12.21□□□□□ -0.45
FCHO1-216ENST00000596536 TJP1Q07157 1748 aa12.21□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 NUP188Q5SRE5 1749 aa12.21□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 NRDCO43847 1150 aa12.21□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 PRDM1O75626 825 aa12.21□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 UBE3CQ15386 1083 aa12.21□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 HPSEQ9Y251 543 aa12.21□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 CEP83Q9Y592 693 aa12.21□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 STX17P56962 302 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 GPS2Q13227 327 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 STAMQ92783 540 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 CABP5Q9NP86 173 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 LRP2BPQ9P2M1 347 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 LRP6O75581 1613 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 FANCGO15287 622 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 AFMP43652 599 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 MAP3K12Q12852 859 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 RESP18Q5W5W9 173 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 CPLX3Q8WVH0 158 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 BPIFA3Q9BQP9 254 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 DESI2Q9BSY9 194 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 GSG1L2A8MUP6 293 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC172P0C7W6 258 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 RTN1Q16799 776 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 PLA2G12BQ9BX93 195 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 INTS13Q9NVM9 706 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 TUBE1Q9UJT0 475 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa12.2□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 PDE8AO60658 829 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 WTAPQ15007 396 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 AKNAD1Q5T1N1 836 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM87BQ96K49 555 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 PPP6R2O75170 966 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 PACS2Q86VP3 889 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 LPIN2Q92539 896 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 VPS54Q9P1Q0 977 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 FBXO3Q9UK99 471 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 PHLPP1O60346 1717 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 ITGB4P16144 1822 aa12.19□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 DDB1Q16531 1140 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 SUSD4Q5VX71 490 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 DHX58Q96C10 678 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 MAN1B1Q9UKM7 699 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 NRAPQ86VF7 1730 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 IKBKBO14920 756 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 CUTAO60888 179 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM22Q8IYM9 498 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 CARD6Q9BX69 1037 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 SLC5A1P13866 664 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 ETF1P62495 437 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 EVX2Q03828 476 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 POSTNQ15063 836 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 ADGRA1Q86SQ6 560 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 13.6
FCHO1-216ENST00000596536 MYH15Q9Y2K3 1946 aa12.18□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 ERICH2A1L162 156 aa12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 MMP1P03956 469 aa12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 MTF1Q14872 753 aa12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 TMCO3Q6UWJ1 677 aa12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 VSTM4Q8IW00 320 aa12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 MNS1Q8NEH6 495 aa12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 GOLGA5Q8TBA6 731 aa12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 EPSTI1Q96J88 318 aa12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
FCHO1-216ENST00000596536 CSRNP2Q9H175 543 aa12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms