RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591097.5

CIRBP-231, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 1 (best)

Gene CIRBP, Length 1,507 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-231	ENST00000591097	TRPA1	O75762	1119 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	ASNS	P08243	561 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	SBK1	Q52WX2	424 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	TSKS	Q9UJT2	592 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	PTPRF	P10586	1907 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	GDF11	O95390	407 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	CCL15	Q16663	113 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	SKAP1	Q86WV1	359 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	GINM1	Q9NU53	330 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		27.94	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	CXCL11	O14625	94 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	CETP	P11597	493 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	MOGS	Q13724	837 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		27.93	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	VPS53	Q5VIR6	699 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	SWAP70	Q9UH65	585 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	APP	P05067	770 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	USP17L5	A8MUK1	530 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	ALDH1A1	P00352	501 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	TDO2	P48775	406 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	LBX1	P52954	281 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		27.91	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	HIP1	O00291	1037 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	GH2	P01242	217 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	TRIM75P	A6NK02	468 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	CDK8	P49336	464 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	WDR18	Q9BV38	432 aa		27.89	■■■□□ 2.06
CIRBP-231	ENST00000591097	BTBD19	C9JJ37	291 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	MYH8	P13535	1937 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	SPP2	Q13103	211 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	NAPB	Q9H115	298 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	TBC1D8	O95759	1140 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	GUCY1A2	P33402	732 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	ALX1	Q15699	326 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	IL25	Q9H293	177 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	ZMYM6	O95789	1325 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	CRHR2	Q13324	411 aa		27.84	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	CHML	P26374	656 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	BACE1	P56817	501 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	CCDC17	Q96LX7	622 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CIRBP-231	ENST00000591097	FGA	P02671	866 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	AKR1B1	P15121	316 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	PPARA	Q07869	468 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	MTMR2	Q13614	643 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	SEPT2	Q15019	361 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	CABP5	Q9NP86	173 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	HMGCS2	P54868	508 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	DGKZ	Q13574	1117 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	RASA1	P20936	1047 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		27.81	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	USP17L10	C9JJH3	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	PDHX	O00330	501 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	RAD50	Q92878	1312 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CIRBP-231	ENST00000591097	GPR25	O00155	361 aa		27.79	■■■□□ 2.04

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