RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFPM1Q8IX07 1006 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXD4L1Q9NU39 408 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 CHMP5Q9NZZ3 219 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 NBPF9Q3BBW0 867 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 NFXL1Q6ZNB6 911 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC44A5Q8NCS7 719 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 BRPF3Q9ULD4 1205 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 PLIN4Q96Q06 1357 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-206ENST00000588815 SHTN1A0MZ66 631 aa36.38■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa36.38■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 APOA5Q6Q788 366 aa36.38■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TCP10L2B9ZVM9 353 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ST3GAL1Q11201 340 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 STK3Q13188 491 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM47AQ5JRC9 791 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 DGKHQ86XP1 1220 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 NECAB1Q8N987 351 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 NEDD1Q8NHV4 660 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 VEZTQ9HBM0 779 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC12A7Q9Y666 1083 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTNAP1P78357 1384 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 NID2Q14112 1375 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SMC3Q9UQE7 1217 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA8BA8MQT2 603 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SCRN1Q12765 414 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 DPY19L2Q6NUT2 758 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKS1AQ92625 1134 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC17Q96LX7 622 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM34Q9BYJ4 488 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB43O43298 467 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD7Q7Z3H4 446 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2R5BQ15173 497 aa36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SCN4AP35499 1836 aa36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 MYH4Q9Y623 1939 aa36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 SHMT1P34896 483 aa36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 CSRNP1Q96S65 589 aa36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 HPS5Q9UPZ3 1129 aa36.33■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa36.32■■■■□ 3.41
CAPNS1-206ENST00000588815 DDNO94850 711 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 EGFRP00533 1210 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP36.31■■■■□ 3.44e-11■□□□□ 10.1
CAPNS1-206ENST00000588815 SENP2Q9HC62 589 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CALM1P0DP23 149 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CALM2P0DP24 149 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CALM3P0DP25 149 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 NUCB2P80303 420 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TATDN1Q6P1N9 297 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF654Q8IZM8 581 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 IL17RBQ9NRM6 502 aa36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 MYH6P13533 1939 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CATIPQ7Z7H3 387 aa36.3■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D12O60347 775 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 DDAH1O94760 285 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CCT2P78371 535 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 RCSD1Q6JBY9 416 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC18Q9H819 358 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 NOVP48745 357 aa36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 HACL1Q9UJ83 578 aa36.28■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA8AA7E2F4 631 aa36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 GJB2P29033 226 aa36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 MICU3Q86XE3 530 aa36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF3AQ9Y496 699 aa36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 NMT2O60551 498 aa36.26■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 EPS15P42566 896 aa36.26■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 PGAP2Q9UHJ9 254 aa36.26■■■■□ 3.4
CAPNS1-206ENST00000588815 CPLX1O14810 134 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 CDKL5O76039 1030 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PDCP20941 246 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K14Q99558 947 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM39BQ9GZU3 492 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 KAT14Q9H8E8 782 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 RASA3Q14644 834 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa36.24■■■■□ 3.39
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa36.24■■■■□ 3.39
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