RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-216	ENST00000588477	PDE3A	Q14432	1141 aa		18.85	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477		Q3C1V9	767 aa		18.85	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	SRGAP3	O43295	1099 aa		18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	ASNS	P08243	561 aa		18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	MAPK4	P31152	587 aa		18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	JAG1	P78504	1218 aa		18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	CCL14	Q16627	93 aa		18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		18.84	■□□□□ 0.61
IFT20-216	ENST00000588477	C19orf81	C9J6K1	198 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	USP17L10	C9JJH3	530 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	LHX8	Q68G74	356 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PORCN	Q9H237	461 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	18.83	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	GDF11	O95390	407 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	RGS2	P41220	211 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MCAM	P43121	646 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	ERVK-9	P63128	1117 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	ERVK-24	P63145	666 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	GPR142	Q7Z601	462 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	USP6NL	Q92738	828 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MORN1	Q5T089	497 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	DNAJC18	Q9H819	358 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	LTBP2	Q14767	1821 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	BAG3	O95817	575 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	RLF	Q13129	1914 aa		18.8	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	POTEB2	H3BUK9	544 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	GNAI3	P08754	354 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MTX1	Q13505	466 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FAM161B	Q96MY7	647 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	APBA2	Q99767	749 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PALD1	Q9ULE6	856 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	EYS	Q5T1H1	3165 aa		18.79	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FLT1	P17948	1338 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PLCG2	P16885	1265 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	GUCD1	Q96NT3	240 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	SNRK	Q9NRH2	765 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		18.78	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	PPP4C	P60510	307 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	MAP2K5	Q13163	448 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	18.77	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	GINM1	Q9NU53	330 aa		18.77	■□□□□ 0.6
IFT20-216	ENST00000588477	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	WDR78	Q5VTH9	848 aa		18.76	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		18.76	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	CNGA1	P29973	690 aa		18.75	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		18.75	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		18.75	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		18.75	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		18.74	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	CNMD	O75829	334 aa		18.74	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	HLA-DOA	P06340	250 aa		18.74	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	CCNA1	P78396	465 aa		18.74	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	USP17L15	C9J2P7	530 aa		18.73	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		18.73	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	USP17L11	C9JVI0	530 aa		18.73	■□□□□ 0.59
IFT20-216	ENST00000588477	USP17L18	D6R9N7	530 aa		18.73	■□□□□ 0.59

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