RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 WTAPQ15007 396 aa27.47■■□□□ 1.99
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RARA-AS1-201ENST00000581080 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.46■■□□□ 1.99
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TSPY8P0CW00 308 aa27.45■■□□□ 1.99
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa27.44■■□□□ 1.98
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TNNI2P48788 182 aa27.43■■□□□ 1.98
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RARA-AS1-201ENST00000581080 IL17RBQ9NRM6 502 aa27.43■■□□□ 1.98
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TRPM4Q8TD43 1214 aa27.43■■□□□ 1.98
RARA-AS1-201ENST00000581080 HPS5Q9UPZ3 1129 aa27.43■■□□□ 1.98
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.43■■□□□ 1.98
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC178Q5BJE1 867 aa27.42■■□□□ 1.98
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM39BQ9GZU3 492 aa27.42■■□□□ 1.98
RARA-AS1-201ENST00000581080 HACL1Q9UJ83 578 aa27.42■■□□□ 1.98
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
RARA-AS1-201ENST00000581080 GOLGA8BA8MQT2 603 aa27.41■■□□□ 1.98
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLURP2P0DP57 97 aa27.41■■□□□ 1.98
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCT2P78371 535 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
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RARA-AS1-201ENST00000581080 PGAP2Q9UHJ9 254 aa27.4■■□□□ 1.98
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZBTB43O43298 467 aa27.4■■□□□ 1.98
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TATDN1Q6P1N9 297 aa27.4■■□□□ 1.98
RARA-AS1-201ENST00000581080 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa27.4■■□□□ 1.98
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RARA-AS1-201ENST00000581080 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.37■■□□□ 1.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBC1D12O60347 775 aa27.36■■□□□ 1.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 TEPSINQ96N21 525 aa27.36■■□□□ 1.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 DEFB129Q9H1M3 183 aa27.36■■□□□ 1.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 RXRAP19793 462 aa27.35■■□□□ 1.97
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RARA-AS1-201ENST00000581080 STX8Q9UNK0 236 aa27.35■■□□□ 1.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 NID2Q14112 1375 aa27.34■■□□□ 1.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.34■■□□□ 1.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 CTDNEP1O95476 244 aa27.34■■□□□ 1.97
RARA-AS1-201ENST00000581080 GJB2P29033 226 aa27.34■■□□□ 1.97
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RARA-AS1-201ENST00000581080 GGA3Q9NZ52 723 aa27.34■■□□□ 1.97
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RARA-AS1-201ENST00000581080 MAP3K10Q02779 954 aa27.33■■□□□ 1.97
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