RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 RAB6AP20340 208 aa8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 NKG7Q16617 165 aa8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.66□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 DNAJA2O60884 412 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 LRIG2O94898 1065 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 ETFBP38117 255 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 ATG4CQ96DT6 458 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 TM9SF2Q99805 663 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 FOXQ1Q9C009 403 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 USP35Q9P2H5 1018 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.65□□□□□ -1.02
TSG101-211ENST00000580814 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 RXRBP28702 533 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 PAOXQ6QHF9 649 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 BEND4Q6ZU67 534 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 FAM13CQ8NE31 585 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 TP53INP1Q96A56 240 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.64□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 TNFRSF10CO14798 259 aa8.63□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 CASP7P55210 303 aa8.63□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 SOGA3Q5TF21 947 aa8.63□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.63□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.63□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 KLHL3Q9UH77 587 aa8.63□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 RAXQ9Y2V3 346 aa8.63□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 NFKBIBQ15653 356 aa8.62□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 TNNI3KQ59H18 835 aa8.62□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 ARSHQ5FYA8 562 aa8.62□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.62□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.62□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.62□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.62□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 STOML1Q9UBI4 398 aa8.62□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 IGSF3O75054 1194 aa8.61□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 GUCY2CP25092 1073 aa8.61□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 CCNFP41002 786 aa8.61□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.61□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.6□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 RGS13O14921 159 aa8.6□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.6□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.6□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.6□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.6□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.6□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 NBPF4Q96M43 638 aa8.6□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.6□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 KLF4O43474 513 aa8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 ACRP10323 421 aa8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 RAG1P15918 1043 aa8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 LGR6Q9HBX8 967 aa8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.59□□□□□ -1.03
TSG101-211ENST00000580814 A0A1W2PQH9 124 aa8.58□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 HMX2A2RU54 273 aa8.58□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 TTC6Q86TZ1 520 aa8.58□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.58□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 GATA6Q92908 595 aa8.58□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 SLC9A7Q96T83 725 aa8.58□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.58□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 RNF43Q68DV7 783 aa8.57□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.57□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.57□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 SLC51AQ86UW1 340 aa8.57□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.57□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 KIF2CQ99661 725 aa8.57□□□□□ -1.04
TSG101-211ENST00000580814 MSTNO14793 375 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.4 ms