RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.75■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 GBP1P32455 592 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 A6NNZ2 444 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 TUBB8Q3ZCM7 444 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF365Q70YC5 407 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 SH2D4AQ9H788 454 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 CEP104O60308 925 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 TAF5LO75529 589 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 PARP10Q53GL7 1025 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 E7EWF7 191 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 PSMB7Q99436 277 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 E7EVH7 732 aa23.74■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 ADCY7P51828 1080 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 BRD1O95696 1058 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 ME3Q16798 604 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.73■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.73■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 ERCC3P19447 782 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 CLUL1Q15846 466 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.72■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 KIFC2Q96AC6 838 aa23.72■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 ZAP70P43403 619 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 RASA3Q14644 834 aa23.72■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 CABP7Q86V35 215 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 CEP120Q8N960 986 aa23.72■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.71■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.71■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 SNX16P57768 344 aa23.71■■□□□ 1.39
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.7■■□□□ 1.39
PTPRM-211ENST00000580170 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.7■■□□□ 1.38
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PTPRM-211ENST00000580170 STRN3Q13033 797 aa23.7■■□□□ 1.38
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PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN26Q16670 478 aa23.69■■□□□ 1.38
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PTPRM-211ENST00000580170 TRPC3Q13507 836 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 UIMC1Q96RL1 719 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRM-211ENST00000580170 VCXQ9H320 206 aa23.69■■□□□ 1.38
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