RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576955.5

PHF23-212, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PHF23, Length 1,944 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-212ENST00000576955 CXCL9Q07325 125 aa28.16■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 ADD1P35611 737 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 PPP2R5BQ15173 497 aa28.16■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 CIAPIN1Q6FI81 312 aa28.16■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 CATIPQ7Z7H3 387 aa28.16■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.16■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.15■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 HLA-DOAP06340 250 aa28.15■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 RASA1P20936 1047 aa28.15■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 CDC27P30260 824 aa28.15■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 NFIAQ12857 509 aa28.15■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa28.15■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa28.15■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 H3BQV1 296 aa28.14■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 RTN1Q16799 776 aa28.14■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 IFFO2Q5TF58 517 aa28.14■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 MCTP1Q6DN14 999 aa28.14■■■□□ 2.1
PHF23-212ENST00000576955 TNIP1Q15025 636 aa28.14■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 NMT2O60551 498 aa28.13■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 CALM1P0DP23 149 aa28.13■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 CALM2P0DP24 149 aa28.13■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 CALM3P0DP25 149 aa28.13■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 DGKHQ86XP1 1220 aa28.13■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 NUP133Q8WUM0 1156 aa28.13■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 SWAP70Q9UH65 585 aa28.13■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 GABPAQ06546 454 aa28.12■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.12■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 FANCBQ8NB91 859 aa28.12■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.12■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 DDAH1O94760 285 aa28.12■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 DLGAP5Q15398 846 aa28.12■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.11■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 SPDYE6P0CI01 402 aa28.11■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 CACNB3P54284 484 aa28.11■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 RASSF7Q02833 373 aa28.11■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 NTRK3Q16288 839 aa28.11■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 ANKS1AQ92625 1134 aa28.11■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 IL17RBQ9NRM6 502 aa28.11■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.11■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 PPFIA3O75145 1194 aa28.1■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 EHD4Q9H223 541 aa28.1■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.1■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 MMP14P50281 582 aa28.1■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.1■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 ENTPD3O75355 529 aa28.09■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 IFNAR1P17181 557 aa28.09■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 TCP10Q12799 353 aa28.09■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 RCSD1Q6JBY9 416 aa28.09■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 KAT14Q9H8E8 782 aa28.09■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.09■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 MYH8P13535 1937 aa28.09■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 TROAPQ12815 778 aa28.08■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.08■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 STK36Q9NRP7 1315 aa28.08■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.08■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 RGS22Q8NE09 1264 aa28.08■■■□□ 2.09
PHF23-212ENST00000576955 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 PI4KBQ9UBF8 816 aa28.07■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.06■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 PHKBQ93100 1093 aa28.06■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 C8orf76Q96K31 380 aa28.06■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 FERMT3Q86UX7 667 aa28.06■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 FZD9O00144 591 aa28.05■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 CHAMP1Q96JM3 812 aa28.05■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.05■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 FOSBP53539 338 aa28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 WASF1Q92558 559 aa28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 SLC26A6Q9BXS9 759 aa28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 STX8Q9UNK0 236 aa28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 ATRNL1Q5VV63 1379 aa28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 TRAK2O60296 914 aa28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 PNMA1Q8ND90 353 aa28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 MAP3K14Q99558 947 aa28.04■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 MYO1BO43795 1136 aa28.03■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 SHMT1P34896 483 aa28.03■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 PRELPP51888 382 aa28.03■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.03■■■□□ 2.08
PHF23-212ENST00000576955 ILDR2Q71H61 639 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms