RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 WDR18Q9BV38 432 aa21.62■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 UNC80Q8N2C7 3258 aa21.62■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 GDF11O95390 407 aa21.61■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 PORCNQ9H237 461 aa21.61■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.61■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.61■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 FOCADQ5VW36 1801 aa21.6■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 ASNSP08243 561 aa21.6■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 COL6A1P12109 1028 aa21.6■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 MCAMP43121 646 aa21.6■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.6■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJC18Q9H819 358 aa21.6■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.6■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 MAPK4P31152 587 aa21.59■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 ERVK-9P63128 1117 aa21.59■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 ERVK-24P63145 666 aa21.59■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 Q3C1V9 767 aa21.59■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 GPR142Q7Z601 462 aa21.59■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 RGS2P41220 211 aa21.58■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 LHX8Q68G74 356 aa21.58■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.58■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.58■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CCDC40-211ENST00000574099 FLT1P17948 1338 aa21.57■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 USP17L10C9JJH3 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 USP6NLQ92738 828 aa21.57■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 APBA2Q99767 749 aa21.57■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 SNRKQ9NRH2 765 aa21.57■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.57■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 C19orf81C9J6K1 198 aa21.56■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 MORN1Q5T089 497 aa21.56■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.56■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 FAM161BQ96MY7 647 aa21.56■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 PALD1Q9ULE6 856 aa21.56■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.56■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.55■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 BAG3O95817 575 aa21.55■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 GNAI3P08754 354 aa21.55■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.55■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.55■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.54■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 MTX1Q13505 466 aa21.54■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 WDR78Q5VTH9 848 aa21.54■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 GUCD1Q96NT3 240 aa21.54■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.54■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 PLCG2P16885 1265 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 MAP2K5Q13163 448 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 FEZ1Q99689 392 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 MYH1P12882 1939 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 LTBP2Q14767 1821 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC40-211ENST00000574099 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 GH2P01242 217 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 CNGA1P29973 690 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 CNMDO75829 334 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 HLA-DOAP06340 250 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 PPP4CP60510 307 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 MFSD14CQ5VZR4 134 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 GINM1Q9NU53 330 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 POTEB2H3BUK9 544 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 EYSQ5T1H1 3165 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 CCNA1P78396 465 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 TNNQ9UQP3 1299 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC40-211ENST00000574099 USP17L15C9J2P7 530 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms