RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	GFRA2	O00451	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	SLITRK5	O94991	958 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ZP2	Q05996	745 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PDE4B	Q07343	736 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	IKZF1	Q13422	519 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	CD96	P40200	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	LIG3	P49916	1009 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	DAB2	P98082	770 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM168A	Q92567	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	MIPEP	Q99797	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ERCC3	P19447	782 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	GRK4	P32298	578 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	AFM	P43652	599 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PSMD2	Q13200	908 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	NKG7	Q16617	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNAP23-215	ENST00000568227	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	ETV3	P41162	512 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	SEPT6	Q14141	434 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	TMC4	Q7Z404	712 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	PGR	P06401	933 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	GDNF	P39905	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	PRR33	A8MZF0	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	CDK8	P49336	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	LMNB2	Q03252	620 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	PWP1	Q13610	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227		H3BS24	57 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	SORBS3	O60504	671 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	BPNT1	O95861	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	CBX7	O95931	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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