RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566253.5

MAN2C1-231, Transcript of mannosidase alpha class 2C member 1, human

TSL 4

Gene MAN2C1, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAN2C1-231	ENST00000566253	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	HOXD10	P28358	340 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	ADD2	P35612	726 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	PLCD1	P51178	756 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	BACE1	P56817	501 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	MTMR2	Q13614	643 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	NBPF11	Q86T75	865 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	LCORL	Q8N3X6	602 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	14.72	□□□□□ -0.05	7e-9	■■■■■ 39.3
MAN2C1-231	ENST00000566253	EHD4	Q9H223	541 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	ARMT1	Q9H993	441 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	GINM1	Q9NU53	330 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	SRRD	Q9UH36	339 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		14.72	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	GH2	P01242	217 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	CHGB	P05060	677 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	OSBP	P22059	807 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	PRMT2	P55345	433 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	ZNF333	Q96JL9	665 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	PNMA3	Q9UL41	463 aa		14.71	□□□□□ -0.05
MAN2C1-231	ENST00000566253	C19orf81	C9J6K1	198 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	USP17L10	C9JJH3	530 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	PRKAB2	O43741	272 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	MBD4	O95243	580 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	FCGRT	P55899	365 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	EVX2	Q03828	476 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	CRBN	Q96SW2	442 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		14.7	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	MYPN	Q86TC9	1320 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	SHMT1	P34896	483 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	UBE3C	Q15386	1083 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	RAET1E	Q8TD07	263 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	MGAM	O43451	1857 aa		14.69	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	CYP2D6	P10635	497 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	PRKCZ	Q05513	592 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	GABPA	Q06546	454 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	GPATCH3	Q96I76	525 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	GABRQ	Q9UN88	632 aa		14.68	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	GRK4	P32298	578 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	CABP5	Q9NP86	173 aa		14.67	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	MYH7	P12883	1935 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	FLT3LG	P49771	235 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	ACER1	Q8TDN7	264 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	FEZ1	Q99689	392 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	BRCA2	P51587	3418 aa		14.66	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	USP17L12	C9JPN9	530 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	USP17L21	D6R901	530 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	SMIM22	K7EJ46	135 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	GUCY1A2	P33402	732 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	SEPT2	Q15019	361 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	MTFR1	Q15390	333 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
MAN2C1-231	ENST00000566253	ADCY3	O60266	1144 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MAN2C1-231	ENST00000566253	PEX10	O60683	326 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MAN2C1-231	ENST00000566253	HERVK_113	P62684	666 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MAN2C1-231	ENST00000566253	C12orf60	Q5U649	245 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MAN2C1-231	ENST00000566253	COA7	Q96BR5	231 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MAN2C1-231	ENST00000566253	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MAN2C1-231	ENST00000566253	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MAN2C1-231	ENST00000566253	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MAN2C1-231	ENST00000566253	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		14.64	□□□□□ -0.07
MAN2C1-231	ENST00000566253	SWAP70	Q9UH65	585 aa		14.64	□□□□□ -0.07

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