RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa37.05■■■■□ 3.52
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CMTM4-204ENST00000563952 HMGCS2P54868 508 aa37.03■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 TATDN1Q6P1N9 297 aa37.03■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 GINM1Q9NU53 330 aa37.03■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 CYP2D6P10635 497 aa37.02■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 EVX2Q03828 476 aa37.02■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 C17orf99Q6UX52 265 aa37.02■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa37.02■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa37.02■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa37.02■■■■□ 3.52
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CMTM4-204ENST00000563952 TREML2Q5T2D2 321 aa37.01■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 WDR18Q9BV38 432 aa37.01■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa37.01■■■■□ 3.52
CMTM4-204ENST00000563952 ADGRA2Q96PE1 1338 aa37.01■■■■□ 3.52
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CMTM4-204ENST00000563952 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa36.97■■■■□ 3.51
CMTM4-204ENST00000563952 FSD1Q9BTV5 496 aa36.97■■■■□ 3.51
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CMTM4-204ENST00000563952 RAB3GAP1Q15042 981 aa36.95■■■■□ 3.51
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CMTM4-204ENST00000563952 AMOTL1Q8IY63 956 aa36.95■■■■□ 3.51
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CMTM4-204ENST00000563952 USP17L21D6R901 530 aa36.93■■■■□ 3.5
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CMTM4-204ENST00000563952 BCRP11274 1271 aa36.92■■■■□ 3.5
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CMTM4-204ENST00000563952 PSMC4P43686 418 aa36.9■■■■□ 3.5
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CMTM4-204ENST00000563952 CTGFP29279 349 aa36.89■■■■□ 3.5
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CMTM4-204ENST00000563952 USP17L2Q6R6M4 530 aa36.87■■■■□ 3.49
CMTM4-204ENST00000563952 CHD1LQ86WJ1 897 aa36.87■■■■□ 3.49
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CMTM4-204ENST00000563952 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa36.87■■■■□ 3.49
CMTM4-204ENST00000563952 GSG1L2A8MUP6 293 aa36.86■■■■□ 3.49
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CMTM4-204ENST00000563952 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
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CMTM4-204ENST00000563952 ACER1Q8TDN7 264 aa36.85■■■■□ 3.49
CMTM4-204ENST00000563952 EVI5LQ96CN4 794 aa36.85■■■■□ 3.49
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CMTM4-204ENST00000563952 GNAT2P19087 354 aa36.84■■■■□ 3.49
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