RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN12	O43309	604 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CALM1	P0DP23	149 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CALM2	P0DP24	149 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CALM3	P0DP25	149 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	MORC3	Q14149	939 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SPECC1	Q5M775	1068 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	HOMER1	Q86YM7	354 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		21.07	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		21.06	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM75P	A6NK02	468 aa		21.06	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	21.06	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		21.06	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	IQCA1	Q86XH1	822 aa		21.06	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		21.06	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	21.06	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CABP5	Q9NP86	173 aa		21.06	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	21.06	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	MYH6	P13533	1939 aa		21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP6	O43182	974 aa		21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	PDE4B	Q07343	736 aa		21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	FOXN1	O15353	648 aa		21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	KRT2	P35908	639 aa		21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA20	Q8TB22	786 aa		21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		21.05	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JS52	829 aa		21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF18	P17022	549 aa		21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	GRIN1	Q05586	938 aa		21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ITPK1	Q13572	414 aa		21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	OXER1	Q8TDS5	423 aa		21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC93	Q567U6	631 aa		21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	FERMT2	Q96AC1	680 aa		21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	CSRNP2	Q9H175	543 aa		21.04	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		21.03	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	FGR	P09769	529 aa		21.03	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	DMTN	Q08495	405 aa		21.03	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	21.03	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		21.03	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	21.03	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	21.03	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	21.02	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA3E	O15041	775 aa		21.02	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	DDAH1	O94760	285 aa		21.02	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	GYG1	P46976	350 aa		21.02	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	PLCD1	P51178	756 aa		21.02	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM232	C9JQI7	657 aa		21.02	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	STX10	O60499	249 aa		21.02	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		21.02	■□□□□ 0.96
RRN3-205	ENST00000563559	PRR29	P0C7W0	189 aa		21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	ATP2B1	P20020	1258 aa		21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	FUT2	Q10981	343 aa		21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	ELF2	Q15723	593 aa		21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	PKN1	Q16512	942 aa		21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	INTS13	Q9NVM9	706 aa		21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	SLFN14	P0C7P3	912 aa		21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	PDILT	Q8N807	584 aa		21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	21.01	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA1S	Q13698	1873 aa		21	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	RGL2	O15211	777 aa		21	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		21	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	21	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		21	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	21	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	TROAP	Q12815	778 aa		20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	DNAI1	Q9UI46	699 aa		20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	20.99	■□□□□ 0.95
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		20.99	■□□□□ 0.95

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