RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	26.36	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		26.36	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		26.36	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		26.36	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	MGAM	O43451	1857 aa		26.35	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	GDF11	O95390	407 aa		26.35	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PLCD1	P51178	756 aa		26.35	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC6	Q86TZ1	520 aa		26.35	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CHGB	P05060	677 aa		26.34	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMC4	P43686	418 aa		26.34	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	BACE1	P56817	501 aa		26.34	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	26.34	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	26.34	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE3C	Q15386	1083 aa		26.33	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		26.33	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	CRBN	Q96SW2	442 aa		26.33	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	26.33	■■□□□ 1.81
PPP4C-205	ENST00000563200	PRMT2	P55345	433 aa		26.32	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	GABPA	Q06546	454 aa		26.32	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF333	Q96JL9	665 aa		26.32	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMT1	Q9H993	441 aa		26.32	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SRRD	Q9UH36	339 aa		26.32	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	EVX2	Q03828	476 aa		26.31	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MTMR2	Q13614	643 aa		26.31	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	26.31	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	26.31	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	GH2	P01242	217 aa		26.31	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SHMT1	P34896	483 aa		26.31	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		26.31	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PNMA3	Q9UL41	463 aa		26.31	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf81	C9J6K1	198 aa		26.3	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MBD4	O95243	580 aa		26.3	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	26.3	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	OSBP	P22059	807 aa		26.3	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		26.3	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		26.3	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	26.29	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	USP17L10	C9JJH3	530 aa		26.29	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKAB2	O43741	272 aa		26.29	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	26.29	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	26.29	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		26.28	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	POTEF	A5A3E0	1075 aa		26.28	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXD10	P28358	340 aa		26.28	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	26.28	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FCGRT	P55899	365 aa		26.28	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	26.28	■■□□□ 1.8	1e-6	■■■■■ 32.2
PPP4C-205	ENST00000563200	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	26.28	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		26.28	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		26.27	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		26.27	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	NBPF11	Q86T75	865 aa		26.27	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		26.27	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		26.27	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	GPATCH3	Q96I76	525 aa		26.27	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	26.27	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		26.27	■■□□□ 1.8
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2D6	P10635	497 aa		26.26	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	26.26	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		26.26	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		26.26	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		26.26	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	MYPN	Q86TC9	1320 aa		26.26	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	GUCY1A2	P33402	732 aa		26.25	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	26.25	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		26.25	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PRKCZ	Q05513	592 aa		26.24	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		26.24	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		26.24	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		26.23	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf42	Q96LP6	360 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	GABRQ	Q9UN88	632 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	MYH8	P13535	1937 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM22	K7EJ46	135 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf60	Q5U649	245 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	RAET1E	Q8TD07	263 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ACER1	Q8TDN7	264 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CABP5	Q9NP86	173 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SWAP70	Q9UH65	585 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		26.22	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	26.21	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	OSBP2	Q969R2	916 aa		26.21	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		26.21	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	26.21	■■□□□ 1.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		26.2	■■□□□ 1.78
PPP4C-205	ENST00000563200	USP17L12	C9JPN9	530 aa		26.2	■■□□□ 1.78
PPP4C-205	ENST00000563200	USP17L21	D6R901	530 aa		26.2	■■□□□ 1.78
PPP4C-205	ENST00000563200	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	26.2	■■□□□ 1.78
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	26.2	■■□□□ 1.78
PPP4C-205	ENST00000563200	GRK4	P32298	578 aa		26.2	■■□□□ 1.78
PPP4C-205	ENST00000563200	AAMP	Q13685	434 aa		26.2	■■□□□ 1.78
PPP4C-205	ENST00000563200	SEPT2	Q15019	361 aa		26.2	■■□□□ 1.78
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		26.2	■■□□□ 1.78

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