RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 DOCK2Q92608 1830 aa14.89□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TLR2O60603 784 aa14.88□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 EVI5LQ96CN4 794 aa14.88□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDR18Q9BV38 432 aa14.88□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CABP5Q9NP86 173 aa14.88□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.88□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP17L12C9JPN9 530 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP17L21D6R901 530 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 GH2P01242 217 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP2D6P10635 497 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 GNAT2P19087 354 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 JAG1P78504 1218 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 GABPAQ06546 454 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARHGEF6Q15052 776 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.87□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 GPAA1O43292 621 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SHMT1P34896 483 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 HMGCS2P54868 508 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 C12orf60Q5U649 245 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SWAP70Q9UH65 585 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRIM17Q9Y577 477 aa14.86□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 C19orf81C9J6K1 198 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP17L10C9JJH3 530 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 M0R2C6 588 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 APPP05067 770 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP2C8P10632 490 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 BACE1P56817 501 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 EVX2Q03828 476 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 MTMR2Q13614 643 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIF22Q14807 665 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CTR9Q6PD62 1173 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 EFCC1Q9HA90 598 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CPA4Q9UI42 421 aa14.85□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 OSBPP22059 807 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 C17orf99Q6UX52 265 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 FEZ1Q99689 392 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PNMA3Q9UL41 463 aa14.84□□□□□ -0.03
USP3-AS1-205ENST00000560067 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TDO2P48775 406 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDK8P49336 464 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TREML2Q5T2D2 321 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TICAM2Q86XR7 235 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 RILPL2Q969X0 211 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.83□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SEPT2Q15019 361 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SBK1Q52WX2 424 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC17Q96LX7 622 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 LAMB1P07942 1786 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 DOCK1Q14185 1865 aa14.82□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 FOCADQ5VW36 1801 aa14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 GUCY1A2P33402 732 aa14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP14P54578 494 aa14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.81□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SIPA1L1O43166 1804 aa14.8□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SMIM22K7EJ46 135 aa14.8□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 BCRP11274 1271 aa14.8□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PSMC4P43686 418 aa14.8□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ACER1Q8TDN7 264 aa14.8□□□□□ -0.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms