RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 SERPINB13Q9UIV8 391 aa26.35■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.35■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 USP17L10C9JJH3 530 aa26.34■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 PDE6AP16499 860 aa26.34■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 UBXN2AP68543 259 aa26.34■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 JAG1P78504 1218 aa26.34■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 MTFR1Q15390 333 aa26.34■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 FAM110CQ1W6H9 321 aa26.34■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 SLAIN1Q8ND83 568 aa26.34■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 COA7Q96BR5 231 aa26.34■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 C19orf81C9J6K1 198 aa26.33■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 FLT3LGP49771 235 aa26.33■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.33■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 PTPRFP10586 1907 aa26.33■■□□□ 1.81
CIPC-208ENST00000557115 GH2P01242 217 aa26.32■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.32■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.32■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 ATAD5Q96QE3 1844 aa26.31■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 ADCY3O60266 1144 aa26.31■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 RNF208Q9H0X6 261 aa26.31■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 EHD4Q9H223 541 aa26.31■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 CCL5P13501 91 aa26.3■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.3■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.3■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 PAG1Q9NWQ8 432 aa26.3■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 SIPA1L1O43166 1804 aa26.3■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.29■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.29■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 FEZ1Q99689 392 aa26.29■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 CABP5Q9NP86 173 aa26.29■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 FOCADQ5VW36 1801 aa26.29■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.28■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 ELNP15502 786 aa26.28■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 ATP5JP18859 108 aa26.28■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 PLCD1P51178 756 aa26.28■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.28■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.28■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.28■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 IRF5Q13568 498 aa26.27■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CIPC-208ENST00000557115 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.26■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 PXYLP1Q8TE99 480 aa26.26■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.26■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 HAUS7Q99871 368 aa26.26■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa26.25■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 INHAP05111 366 aa26.25■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 GJB1P08034 283 aa26.25■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 HERVK_113P62684 666 aa26.25■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 LCORLQ8N3X6 602 aa26.25■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 BRCA2P51587 3418 aa26.24■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 GJA8P48165 433 aa26.24■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa26.24■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 UNC93B1Q9H1C4 597 aa26.24■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 ARMT1Q9H993 441 aa26.24■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.24■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 MYH1P12882 1939 aa26.24■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 MGAMO43451 1857 aa26.23■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 SLC34A2O95436 690 aa26.23■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 SHMT1P34896 483 aa26.23■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 ADD2P35612 726 aa26.23■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 USP14P54578 494 aa26.23■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 GCC1Q96CN9 775 aa26.23■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 MORF4L1Q9UBU8 362 aa26.23■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 MBD4O95243 580 aa26.22■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 SHISA4Q96DD7 197 aa26.22■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.21■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 PAGR1Q9BTK6 254 aa26.21■■□□□ 1.79
CIPC-208ENST00000557115 GABPAQ06546 454 aa26.2■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.2■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.2■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.2■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 GPATCH3Q96I76 525 aa26.2■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 TXNRD2Q9NNW7 524 aa26.2■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 USP17L15C9J2P7 530 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 USP17L11C9JVI0 530 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 USP17L18D6R9N7 530 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 USP17L22D6RA61 530 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 USP17L19D6RCP7 530 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 USP17L20D6RJB6 530 aa26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms