RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 SYN1P17600 705 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 CCNA1P78396 465 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 TRIM32Q13049 653 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 MORN1Q5T089 497 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 CERS3Q8IU89 383 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 USP6NLQ92738 828 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 MEIS3Q99687 375 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 AK9Q5TCS8 1911 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-233ENST00000552688 CEP290O15078 2479 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 MGAMO43451 1857 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 PFASO15067 1338 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 MSCO60682 206 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 HLA-DOAP06340 250 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 TRIM27P14373 513 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 ERVK-9P63128 1117 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 ERVK-24P63145 666 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 LHX8Q68G74 356 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 GPR142Q7Z601 462 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 PANK1Q8TE04 598 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 APBA2Q99767 749 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 DOCK2Q92608 1830 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 POTEB2H3BUK9 544 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 GNAI2P04899 355 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 RLBP1P12271 317 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 MCAMP43121 646 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP14P54578 494 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 MAP2K5Q13163 448 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 Q3C1V9 767 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 PI16Q6UXB8 463 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 Q7L0L9 218 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 C12orf42Q96LP6 360 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 GPR108Q9NPR9 543 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 DOCK1Q14185 1865 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 FLT1P17948 1338 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP17L15C9J2P7 530 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP17L11C9JVI0 530 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP17L18D6R9N7 530 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP17L22D6RA61 530 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP17L19D6RCP7 530 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP17L20D6RJB6 530 aa8.37□□□□□ -1.07
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CS-233ENST00000552688 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 USP17L24Q0WX57 530 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.37□□□□□ -1.07
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CS-233ENST00000552688 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.37□□□□□ -1.07
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CS-233ENST00000552688 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 PALD1Q9ULE6 856 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 DNM1LO00429 736 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 GDF11O95390 407 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 JAG1P78504 1218 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 ATP2B2Q01814 1243 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 CCL14Q16627 93 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-233ENST00000552688 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.36□□□□□ -1.07
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