RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.3□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 FBF1Q8TES7 1133 aa8.3□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.3□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 MAPK8P45983 427 aa8.29□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 FYB2Q5VWT5 728 aa8.29□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.29□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.29□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.28□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
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USP15-218ENST00000552346 SLITRK5O94991 958 aa8.27□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 KIRREL1Q96J84 757 aa8.27□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.27□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.27□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 GIPC1O14908 333 aa8.26□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 CELA3AP09093 270 aa8.26□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.26□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 SETDB2Q96T68 719 aa8.26□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.26□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 ITGAEP38570 1179 aa8.25□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.25□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.25□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.25□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 H3BS24 57 aa8.24□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.24□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 HDXQ7Z353 690 aa8.24□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 TOX2Q96NM4 488 aa8.24□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.24□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 TSPAN15O95858 294 aa8.23□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.23□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.23□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 PARP2Q9UGN5 583 aa8.23□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.23□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 SPG7Q9UQ90 795 aa8.23□□□□□ -1.09
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USP15-218ENST00000552346 DAB2P98082 770 aa8.22□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 ATP2B2Q01814 1243 aa8.22□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 NKG7Q16617 165 aa8.22□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 C12orf49Q9H741 205 aa8.22□□□□□ -1.09
USP15-218ENST00000552346 USP17L7P0C7H9 530 aa8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 CFPP27918 469 aa8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 CAP2P40123 477 aa8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 HID1Q8IV36 788 aa8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 RIN3Q8TB24 985 aa8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 DRC1Q96MC2 740 aa8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.21□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 CBX7O95931 251 aa8.2□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.2□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.2□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 CCDC120Q96HB5 630 aa8.2□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.2□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 SORBS3O60504 671 aa8.19□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 SV2BQ7L1I2 683 aa8.19□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.19□□□□□ -1.1
USP15-218ENST00000552346 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.19□□□□□ -1.1
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