RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552301.1

PRPF40B-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF40B, Length 912 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40B-216ENST00000552301 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.13■■□□□ 1.13
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PRPF40B-216ENST00000552301 CABP5Q9NP86 173 aa22.12■■□□□ 1.13
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PRPF40B-216ENST00000552301 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.11■■□□□ 1.13
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PRPF40B-216ENST00000552301 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.1■■□□□ 1.13
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PRPF40B-216ENST00000552301 NAPBQ9H115 298 aa22.09■■□□□ 1.13
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PRPF40B-216ENST00000552301 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.02■■□□□ 1.12
PRPF40B-216ENST00000552301 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.02■■□□□ 1.12
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PRPF40B-216ENST00000552301 PDE4BQ07343 736 aa22.01■■□□□ 1.11
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PRPF40B-216ENST00000552301 VPS53Q5VIR6 699 aa22.01■■□□□ 1.11
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