RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 WNK4Q96J92 1243 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 SWAP70Q9UH65 585 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 ZMYM6O95789 1325 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 PRDM1O75626 825 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 SPRYD7Q5W111 196 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 OTUD5Q96G74 571 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 PICK1Q9NRD5 415 aa22.36■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 GH2P01242 217 aa22.35■■□□□ 1.17
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CTDSP2-207ENST00000551594 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.35■■□□□ 1.17
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CTDSP2-207ENST00000551594 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.35■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 AKR1B1P15121 316 aa22.34■■□□□ 1.17
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CTDSP2-207ENST00000551594 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.34■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 RASA1P20936 1047 aa22.33■■□□□ 1.17
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CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF213O14771 459 aa22.32■■□□□ 1.16
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CTDSP2-207ENST00000551594 PPATQ06203 517 aa22.32■■□□□ 1.16
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CTDSP2-207ENST00000551594 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.32■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 IRF6O14896 467 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 ASNSP08243 561 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 GUCY1A2P33402 732 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 NOGQ13253 232 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 PPIL2Q13356 520 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 CABP5Q9NP86 173 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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CTDSP2-207ENST00000551594 PCNTO95613 3336 aa22.31■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 USP17L5A8MUK1 530 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 SEPT2Q15019 361 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.3■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.29■■□□□ 1.16
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CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 GINM1Q9NU53 330 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.29■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 TRIM75PA6NK02 468 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 CYP21A2P08686 494 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 FGRP09769 529 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 SPP2Q13103 211 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 TOMM22Q9NS69 142 aa22.28■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 ORC4O43929 436 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 MAP2K2P36507 400 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 NEDD4P46934 1319 aa22.27■■□□□ 1.16
CTDSP2-207ENST00000551594 PTPRFP10586 1907 aa22.26■■□□□ 1.15
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CTDSP2-207ENST00000551594 TFAP4Q01664 338 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 ACER1Q8TDN7 264 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 WDR18Q9BV38 432 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.26■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 TSPY3P0CV98 308 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 TSPY8P0CW00 308 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 GTF2A2P52657 109 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 SNAPC2Q13487 334 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 DGKZQ13574 1117 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 NECTIN1Q15223 517 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 CCL15Q16663 113 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.25■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 CXCL11O14625 94 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC27A2O14975 620 aa22.24■■□□□ 1.15
CTDSP2-207ENST00000551594 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.24■■□□□ 1.15
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