RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 INHBEP58166 350 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-209ENST00000550857 METTL23Q86XA0 190 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-209ENST00000550857 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-209ENST00000550857 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-209ENST00000550857 AMNQ9BXJ7 453 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-209ENST00000550857 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-209ENST00000550857 CCPG1Q9ULG6 757 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRB-209ENST00000550857 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 UBE3CQ15386 1083 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 MEIS3Q99687 375 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 DEPTORQ8TB45 409 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 KIFAP3Q92845 792 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 KIFC2Q96AC6 838 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ZMYND15Q9H091 742 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 YEATS4O95619 227 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ELF1P32519 619 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 TTC22Q5TAA0 569 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 SLFN12Q8IYM2 578 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 MB21D1Q8N884 522 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 HUNKP57058 714 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP25Q9UHP3 1055 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 F8W8V4 182 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ARID5AQ03989 594 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CFAP100Q494V2 611 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 HTATIP2Q9BUP3 242 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 PLSCR1O15162 318 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 NLRP10Q86W26 655 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ELMOD1Q8N336 334 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP19O94966 1318 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CCND2P30279 289 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 PDE1AP54750 535 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 SPAG5Q96R06 1193 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CA12O43570 354 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ECE2O60344 883 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CFBP00751 764 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ATP5JP18859 108 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 KIAA1328Q86T90 577 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 LAMC1P11047 1609 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 DLC1Q96QB1 1528 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 GTF2A2P52657 109 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 TSPY26PQ9H489 355 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CPDO75976 1380 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP17L15C9J2P7 530 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP17L11C9JVI0 530 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP17L18D6R9N7 530 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP17L22D6RA61 530 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP17L19D6RCP7 530 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP17L20D6RJB6 530 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 DDAH1O94760 285 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 PTPREP23469 700 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 TFAP4Q01664 338 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 USP17L24Q0WX57 530 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 COPRSQ9NQ92 184 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 FAM50BQ9Y247 325 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-209ENST00000550857 GAS7O60861 476 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms