RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547310.1

LGR5-204, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, human

TSL 3

Gene LGR5, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGR5-204	ENST00000547310	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		7.58	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	CD8B	P10966	210 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	ASPA	P45381	313 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	MAP7	Q14244	749 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	MLANA	Q16655	118 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	DYM	Q7RTS9	669 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	RNF214	Q8ND24	703 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		7.57	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	LMNB1	P20700	586 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF76	P36508	570 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	VAV3	Q9UKW4	847 aa		7.56	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	GFRA2	O00451	464 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	FANCG	O15287	622 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	INHBB	P09529	407 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	GGT7	Q9UJ14	662 aa		7.55	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	FAM221A	A4D161	298 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	PF4	P02776	101 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	GART	P22102	1010 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	NTF4	P34130	210 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	SEPT6	Q14141	434 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	INPP5A	Q14642	412 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	HDX	Q7Z353	690 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	RNF34	Q969K3	372 aa		7.54	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	CILP	O75339	1184 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	KRT1	P04264	644 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	TTLL4	Q14679	1199 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	COPRS	Q9NQ92	184 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		7.53	□□□□□ -1.2
LGR5-204	ENST00000547310	GREM1	O60565	184 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	NEFM	P07197	916 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	NFIC	P08651	508 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	PRKCQ	Q04759	706 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	LRRC3	Q9BY71	257 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	PIDD1	Q9HB75	910 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		7.52	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	F13A1	P00488	732 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	KCNMB1	Q16558	191 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	KCT2	Q8NC54	265 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	NETO1	Q8TDF5	533 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	C20orf173	Q96LM9	149 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		7.51	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	C1QTNF9	P0C862	333 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	RAB6A	P20340	208 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	CAP2	P40123	477 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	PPM1J	Q5JR12	505 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	RELT	Q969Z4	430 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	ISL2	Q96A47	359 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		7.5	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310		F6X3S4	739 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	CDK8	P49336	464 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	MPP2	Q14168	576 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		7.49	□□□□□ -1.21
LGR5-204	ENST00000547310	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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