RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA2G5P39877 138 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 CAP2P40123 477 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 CRHR2Q13324 411 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 BRI3BPQ8WY22 251 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC17Q96LX7 622 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 MCM9Q9NXL9 1143 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 FZD1Q9UP38 647 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 AOX1Q06278 1338 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.73□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM75PA6NK02 468 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 APPP05067 770 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 MX1P20591 662 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 FCGRTP55899 365 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 CCNA1P78396 465 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD45Q5TZF3 282 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 COA7Q96BR5 231 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 FEZ1Q99689 392 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR18Q9BV38 432 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 PALD1Q9ULE6 856 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 SSC5DA1L4H1 1573 aa6.72□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.71□□□□□ -1.33
CLSTN3-215ENST00000544584 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 HIP1O00291 1037 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ADD2P35612 726 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 GJA5P36382 358 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 BACE1P56817 501 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 UBXN2AP68543 259 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE4BQ07343 736 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SPP2Q13103 211 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM43AQ8N2R8 423 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB123Q8N688 67 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 RAET1EQ8TD07 263 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 APPBP2Q92624 585 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 EVI5LQ96CN4 794 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 PTPN18Q99952 460 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 FSD1Q9BTV5 496 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ALPK3Q96L96 1907 aa6.71□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MBD4O95243 580 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TDO2P48775 406 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 NT5C2P49902 561 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 HMGCS2P54868 508 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TATDN1Q6P1N9 297 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF384Q8TF68 577 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM47Q96LD4 638 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CRBNQ96SW2 442 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L15C9J2P7 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L11C9JVI0 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L18D6R9N7 530 aa6.69□□□□□ -1.34
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