RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
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TRDN-204ENST00000542443 PWP1Q13610 501 aa8.01□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 MAP3K11Q16584 847 aa8.01□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 ZNF394Q53GI3 561 aa8.01□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 RELL1Q8IUW5 271 aa8.01□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 PHC3Q8NDX5 983 aa8.01□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 TMEM74Q96NL1 305 aa8.01□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.01□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.01□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8□□□□□ -1.13
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TRDN-204ENST00000542443 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 AGMOQ6ZNB7 445 aa8□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 USP48Q86UV5 1035 aa8□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 TGIF2Q9GZN2 237 aa8□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 F6X3S4 739 aa7.99□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.99□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.99□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.99□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 KCT2Q8NC54 265 aa7.99□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 RHOVQ96L33 236 aa7.99□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.99□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.99□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.99□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.98□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.98□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.98□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.98□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.98□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.98□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.98□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
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TRDN-204ENST00000542443 IKZF1Q13422 519 aa7.97□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 HDXQ7Z353 690 aa7.97□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.97□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.97□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.97□□□□□ -1.13
TRDN-204ENST00000542443 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
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TRDN-204ENST00000542443 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.95□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.95□□□□□ -1.14
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TRDN-204ENST00000542443 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.95□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.95□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.95□□□□□ -1.14
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TRDN-204ENST00000542443 C8orf37Q96NL8 207 aa7.94□□□□□ -1.14
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TRDN-204ENST00000542443 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.94□□□□□ -1.14
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TRDN-204ENST00000542443 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
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TRDN-204ENST00000542443 GREM1O60565 184 aa7.93□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.93□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 SEPT6Q14141 434 aa7.93□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 NKG7Q16617 165 aa7.93□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.93□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 SPON2Q9BUD6 331 aa7.93□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.93□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.93□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 CLCN7P51798 805 aa7.92□□□□□ -1.14
TRDN-204ENST00000542443 FZD5Q13467 585 aa7.92□□□□□ -1.14
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