RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539490.1

DYRK4-208, Transcript of dual specificity tyrosine phosphorylation regulated kinase 4, human

TSL 2

Gene DYRK4, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYRK4-208	ENST00000539490	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	TRIM17	Q9Y577	477 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	LAMB1	P07942	1786 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	CRK	P46108	304 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	LRRC24	Q50LG9	513 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	VPS37D	Q86XT2	251 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	OPTN	Q96CV9	577 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	TEPSIN	Q96N21	525 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	PTPN18	Q99952	460 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	ELP3	Q9H9T3	547 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	OTOF	Q9HC10	1997 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	UTY	O14607	1347 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	TNNI2	P48788	182 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	CRHR2	Q13324	411 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	GRIK5	Q16478	980 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	METTL24	Q5JXM2	366 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	ERO1A	Q96HE7	468 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		7.35	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490		A6NJR5	290 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	PDE8B	O95263	885 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	CACNB3	P54284	484 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	SP3	Q02447	781 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	TRIM32	Q13049	653 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	BAP1	Q92560	729 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	USP44	Q9H0E7	712 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	EFCC1	Q9HA90	598 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF521	Q96K83	1311 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	GPR37L1	O60883	481 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	GTF2A2	P52657	109 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	CAP1	Q01518	475 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	VGLL4	Q14135	290 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	CCL15	Q16663	113 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	TEKT1	Q969V4	418 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	MRI	Q9BWK5	157 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	CENPF	P49454	3210 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	PTPRC	P08575	1304 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	FGFR2	P21802	821 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	SLC19A1	P41440	591 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	RPIA	P49247	311 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	AGER	Q15109	404 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM83A	Q86UY5	434 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	ZNF511	Q8NB15	262 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490		E9PSI1	815 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	EYA2	O00167	538 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	SLFN5	Q08AF3	891 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	IRF5	Q13568	498 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	ARHGEF6	Q15052	776 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DYRK4-208	ENST00000539490	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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