RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
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PTPRK-222ENST00000532751 BTBD19C9JJ37 291 aa26.29■■□□□ 1.8
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PTPRK-222ENST00000532751 CTR9Q6PD62 1173 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRK-222ENST00000532751 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.29■■□□□ 1.8
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PTPRK-222ENST00000532751 TDO2P48775 406 aa26.28■■□□□ 1.8
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PTPRK-222ENST00000532751 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.27■■□□□ 1.8
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PTPRK-222ENST00000532751 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.26■■□□□ 1.79
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PTPRK-222ENST00000532751 JAG1P78504 1218 aa26.25■■□□□ 1.79
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PTPRK-222ENST00000532751 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.24■■□□□ 1.79
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PTPRK-222ENST00000532751 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.23■■□□□ 1.79
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
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PTPRK-222ENST00000532751 BACE1P56817 501 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRK-222ENST00000532751 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.21■■□□□ 1.79
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PTPRK-222ENST00000532751 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa26.21■■□□□ 1.79
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.2■■□□□ 1.78
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PTPRK-222ENST00000532751 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRK-222ENST00000532751 SEPT2Q15019 361 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRK-222ENST00000532751 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRK-222ENST00000532751 PNMA3Q9UL41 463 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRK-222ENST00000532751 AKR1B1P15121 316 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRK-222ENST00000532751 GUCY1A2P33402 732 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRK-222ENST00000532751 USP14P54578 494 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRK-222ENST00000532751 SP3Q02447 781 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRK-222ENST00000532751 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.17■■□□□ 1.78
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