RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531951.5

PUF60-217, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 973 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-217ENST00000531951 KDM4AO75164 1064 aa22.28■■□□□ 1.16
PUF60-217ENST00000531951 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PUF60-217ENST00000531951 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PUF60-217ENST00000531951 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.28■■□□□ 1.16
PUF60-217ENST00000531951 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.28■■□□□ 1.16
PUF60-217ENST00000531951 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.27■■□□□ 1.16
PUF60-217ENST00000531951 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PUF60-217ENST00000531951 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.27■■□□□ 1.16
PUF60-217ENST00000531951 CCDC17Q96LX7 622 aa22.27■■□□□ 1.16
PUF60-217ENST00000531951 TSPY2A6NKD2 308 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 CPA1P15085 419 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 AKR1B1P15121 316 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 MCM5P33992 734 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 RABEP1Q15276 862 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 RUFY3Q7L099 469 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 TSPY3P0CV98 308 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 TSPY8P0CW00 308 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 RPS6KB1P23443 525 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 ANTXR2P58335 489 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 TFAP4Q01664 338 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 PTPRFP10586 1907 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 PRC1O43663 620 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 GDF11O95390 407 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 KLRG1Q96E93 195 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 FZD1Q9UP38 647 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 TOMM70O94826 608 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 CAP2P40123 477 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 CHST3Q7LGC8 479 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 WRNIP1Q96S55 665 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 MTA3Q9BTC8 594 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 INPP5BP32019 993 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 NEK4P51957 841 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 JAG1P78504 1218 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 PRKG1Q13976 671 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 MAP3K11Q16584 847 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 IQCA1Q86XH1 822 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 GINM1Q9NU53 330 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 GH2P01242 217 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 IL27Q8NEV9 243 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 TMEM87BQ96K49 555 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 TTC14Q96N46 770 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 CABP5Q9NP86 173 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 PASKQ96RG2 1323 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-217ENST00000531951 NMT2O60551 498 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 ASNSP08243 561 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 FKBP1BP68106 108 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 TNKSO95271 1327 aa22.2■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 GUCY1A2P33402 732 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 SEPT2Q15019 361 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 FBXL16Q8N461 479 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 CEP95Q96GE4 821 aa22.19■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 ERICH2A1L162 156 aa22.18■■□□□ 1.14
PUF60-217ENST00000531951 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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