RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	OTUD5	Q96G74	571 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	ZIC5	Q96T25	663 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	ZMYM6	O95789	1325 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	GH2	P01242	217 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	RASA1	P20936	1047 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	VEGFB	P49765	207 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	WNK4	Q96J92	1243 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	PICK1	Q9NRD5	415 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	TOMM22	Q9NS69	142 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	SWAP70	Q9UH65	585 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	NEDD4	P46934	1319 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF213	O14771	459 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	PTPRA	P18433	802 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	SEPT2	Q15019	361 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	SPRYD7	Q5W111	196 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	MAP4K1	Q92918	833 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	CYP21A2	P08686	494 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	GUCY1A2	P33402	732 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	DGKZ	Q13574	1117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	ERO1B	Q86YB8	467 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		10.78	□□□□□ -0.68
RBM25-208	ENST00000530978	TRIM75P	A6NK02	468 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	IRF6	O14896	467 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	SLC27A2	O14975	620 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	SEC24B	O95487	1268 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	ECE1	P42892	770 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	PDE4B	Q07343	736 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	C8orf34	Q49A92	452 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC102A	Q96A19	550 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	CABP5	Q9NP86	173 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	PTPRF	P10586	1907 aa		10.77	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	TSPY2	A6NKD2	308 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	USP17L5	A8MUK1	530 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978		B4E1Z4	1266 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	NMT2	O60551	498 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	ASNS	P08243	561 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	TFAP4	Q01664	338 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	ATP2B2	Q01814	1243 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	PPAT	Q06203	517 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	SPP2	Q13103	211 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	PPIL2	Q13356	520 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	ACER1	Q8TDN7	264 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		10.76	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978		E7EWF7	191 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	ORC4	O43929	436 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	KDM4A	O75164	1064 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	REC8	O95072	547 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	TSPY3	P0CV98	308 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	TSPY8	P0CW00	308 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	ICA1	Q05084	483 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	NOG	Q13253	232 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	MTMR2	Q13614	643 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	NECTIN1	Q15223	517 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC17	Q96LX7	622 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		10.75	□□□□□ -0.69
RBM25-208	ENST00000530978	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		10.75	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms