RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 RING1Q06587 406 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 RELL1Q8IUW5 271 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 KCT2Q8NC54 265 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 PHC3Q8NDX5 983 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-214ENST00000530727 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 NTF4P34130 210 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 CDK8P49336 464 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 SYNJ2O15056 1496 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 GRIN2AQ12879 1464 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 PWP1Q13610 501 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 XP32Q5T750 250 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 SAMD9Q5K651 1589 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM74Q96NL1 305 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 LEFTY1O75610 366 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 PF4P02776 101 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 SPINK2P20155 84 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 DTX1Q86Y01 620 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 BPNT1O95861 308 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 GRK4P32298 578 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 LMNB2Q03252 620 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 MSMPQ1L6U9 139 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 NUP160Q12769 1436 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 IQGAP2Q13576 1575 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 CEP170Q5SW79 1584 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 GFRA2O00451 464 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 RHOVQ96L33 236 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 FBRSQ9HAH7 460 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 LRIG2O94898 1065 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 HID1Q8IV36 788 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 GGT7Q9UJ14 662 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 CHD1O14646 1710 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 WNT11O96014 354 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 PGRP06401 933 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 PDE4BQ07343 736 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 GATAD2BQ8WXI9 593 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 FOXQ1Q9C009 403 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 COPRSQ9NQ92 184 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 F13A1P00488 732 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 NKG7Q16617 165 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 POLR3GLQ9BT43 218 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 CILPO75339 1184 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-214ENST00000530727 DISP1Q96F81 1524 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 VSIG10LQ86VR7 867 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 MIPEPQ99797 713 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC39Q9UFE4 941 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 MAP3K1Q13233 1512 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 FAM221AA4D161 298 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 ADAMTS4O75173 837 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 CAP2P40123 477 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRC-214ENST00000530727 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms