RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 NEK4P51957 841 aa26.86■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.86■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 IL17RAQ96F46 866 aa26.86■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.86■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPY2A6NKD2 308 aa26.85■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 PSMA5P28066 241 aa26.85■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.85■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.85■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 RUFY3Q7L099 469 aa26.85■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 ESR2Q92731 530 aa26.85■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 PRC1O43663 620 aa26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS6KB1P23443 525 aa26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 CHADLQ6NUI6 762 aa26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 TBC1D12O60347 775 aa26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP3K10Q02779 954 aa26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 LAMB1P07942 1786 aa26.84■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPY3P0CV98 308 aa26.83■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPY8P0CW00 308 aa26.83■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 INPP5BP32019 993 aa26.83■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.83■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 SENP2Q9HC62 589 aa26.83■■□□□ 1.89
TSNARE1-208ENST00000524325 LAMA4Q16363 1823 aa26.83■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 GH2P01242 217 aa26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 MCM5P33992 734 aa26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 WRNIP1Q96S55 665 aa26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.82■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 DCAF15Q66K64 600 aa26.81■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 RABEP1Q15276 862 aa26.8■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.8■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.8■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 Q6ZUG5 572 aa26.8■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 SEPT2Q15019 361 aa26.79■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.79■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 GUCY1A2P33402 732 aa26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 KLRG1Q96E93 195 aa26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC14Q96N46 770 aa26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 CAP2P40123 477 aa26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP95Q96GE4 821 aa26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TNKSO95271 1327 aa26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 CELF2O95319 508 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 NF2P35240 595 aa26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 FGD1P98174 961 aa26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 HOOK2Q96ED9 719 aa26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 AK2P54819 239 aa26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP2B2Q01814 1243 aa26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 IQCA1Q86XH1 822 aa26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 BRF1Q92994 677 aa26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC17Q96LX7 622 aa26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.76■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 CST9Q5W186 159 aa26.75■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 STX8Q9UNK0 236 aa26.75■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.75■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC23AQ15436 765 aa26.74■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.74■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 LY9Q9HBG7 655 aa26.74■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 CABP5Q9NP86 173 aa26.74■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.73■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 APOBRQ0VD83 1088 aa26.73■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.73■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.73■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 MTMR7Q9Y216 660 aa26.73■■□□□ 1.87
TSNARE1-208ENST00000524325 VGLL4Q14135 290 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.5 ms