RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523839.5

RAD54B-208, Transcript of RAD54 homolog B, human

TSL 3

Gene RAD54B, Length 472 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD54B-208	ENST00000523839	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	LEFTY1	O75610	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	LRIG2	O94898	1065 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	LMNB1	P20700	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	OXCT1	P55809	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	PSMD2	Q13200	908 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	CEACAM5	P06731	702 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	LIG3	P49916	1009 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	INPP5A	Q14642	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	CTSW	P56202	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RAD54B-208	ENST00000523839	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.53	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	GFRA2	O00451	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	NFIB	O00712	420 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	INHBB	P09529	407 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	CD96	P40200	585 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	CLCN7	P51798	805 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	AOC3	Q16853	763 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	HID1	Q8IV36	788 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	RNF19A	Q9NV58	838 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839		U3KQE9	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	SORBS3	O60504	671 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	EOMES	O95936	686 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	SLITRK5	O94991	958 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	KRT1	P04264	644 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	CTSH	P09668	335 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	GRK4	P32298	578 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	PDE4B	Q07343	736 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	PWP1	Q13610	501 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	SEPT6	Q14141	434 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	GLI1	P08151	1106 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	ITIH2	P19823	946 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	AFM	P43652	599 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	LMNB2	Q03252	620 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	NKG7	Q16617	165 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RAD54B-208	ENST00000523839	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.49	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms