RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 H3BRJ5 948 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 NOP56O00567 594 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 BNIP3LO60238 219 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 MAN1A2O60476 641 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 SIN3BO75182 1162 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAPGEF3O95398 923 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLFN14P0C7P3 912 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 FGFR1P11362 822 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATF3P18847 181 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 CD33P20138 364 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 FGFR3P22607 806 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 NEK2P51955 445 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAPQ12884 760 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP4R4Q6NUP7 873 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 POMZP3Q6PJE2 187 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 HFE2Q6ZVN8 426 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM35AQ86V20 835 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDAN1Q8IWY9 1227 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 WDR66Q8TBY9 1149 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 TTC9Q92623 222 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 STRN4Q9NRL3 753 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 LTBP3Q9NS15 1303 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A1W2PQU0 124 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZBTB42B2RXF5 422 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 NAT1P18440 290 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 L1CAMP32004 1257 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 GABREP78334 506 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 PIP4K2BP78356 416 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 GSTM4Q03013 218 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 C19orf57Q0VDD7 668 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 NSMFQ6X4W1 530 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 STK35Q8TDR2 534 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 DCAF11Q8TEB1 546 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHMP4CQ96CF2 233 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLPPR2Q96GM1 343 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC9A7Q96T83 725 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARNT2Q9HBZ2 717 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 OSGEPQ9NPF4 335 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 PICK1Q9NRD5 415 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZEB2O60315 1214 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPM1BO75688 479 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ASLP04424 464 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 PGRP06401 933 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACRP10323 421 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 CPB1P15086 417 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 NEK4P51957 841 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ETF1P62495 437 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 MCL1Q07820 350 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITKQ08881 620 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 POU4F3Q15319 338 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 GFOD2Q3B7J2 385 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 MAP9Q49MG5 647 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRIM61Q5EBN2 209 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 NXNQ6DKJ4 435 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRFN4Q6PJG9 635 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 CYFIP1Q7L576 1253 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 SYT9Q86SS6 491 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZBTB46Q86UZ6 589 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANKLE2Q86XL3 938 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLFN12Q8IYM2 578 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBR7Q8N806 425 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 GPBAR1Q8TDU6 330 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLHL6Q8WZ60 621 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 USP7Q93009 1102 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 ABHD17AQ96GS6 310 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 EXOC2Q96KP1 924 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCDC140Q96MF4 163 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 TTC1Q99614 292 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 LACRTQ9GZZ8 138 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-928P-201ENST00000516876 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms