RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.65■□□□□ 0.9
HERC3-211ENST00000513325 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.65■□□□□ 0.9
HERC3-211ENST00000513325 HLA-DOAP06340 250 aa20.64■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.64■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.64■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 FOCADQ5VW36 1801 aa20.64■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 SGPL1O95470 568 aa20.63■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 DPF3Q92784 378 aa20.63■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.63■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 GINM1Q9NU53 330 aa20.63■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.63■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.63■□□□□ 0.89
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HERC3-211ENST00000513325 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K12Q12852 859 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 C19orf81C9J6K1 198 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 USP17L10C9JJH3 530 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 CERS3Q8IU89 383 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 DEFB118Q96PH6 123 aa20.61■□□□□ 0.89
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HERC3-211ENST00000513325 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 GJD2Q9UKL4 321 aa20.6■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 PEX10O60683 326 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 GH2P01242 217 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 MS4A1P11836 297 aa20.59■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 APBB1O00213 710 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 HERVK_113P62684 666 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.58■□□□□ 0.89
HERC3-211ENST00000513325 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 TTC6Q86TZ1 520 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 EHD4Q9H223 541 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 MYH1P12882 1939 aa20.57■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 HMGCRP04035 888 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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HERC3-211ENST00000513325 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.56■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 BCL11AQ9H165 835 aa20.56■□□□□ 0.88
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HERC3-211ENST00000513325 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.55■□□□□ 0.88
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HERC3-211ENST00000513325 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 HMMRO75330 724 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 PDE6AP16499 860 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 CYP2B6P20813 491 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 PLCD1P51178 756 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 Q3C1V9 767 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 FEZ1Q99689 392 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.54■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 GOLIM4O00461 696 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 SHMT1P34896 483 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 ERVK-9P63128 1117 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 ERVK-24P63145 666 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 TRIB2Q92519 343 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 C12orf42Q96LP6 360 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 RPTORQ8N122 1335 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.53■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 MAPK4P31152 587 aa20.52■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 PORCNQ9H237 461 aa20.52■□□□□ 0.88
HERC3-211ENST00000513325 CABP5Q9NP86 173 aa20.52■□□□□ 0.88
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