RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512247.5

LNX1-208, Transcript of ligand of numb-protein X 1, human

TSL 3

Gene LNX1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LNX1-208	ENST00000512247	USP38	Q8NB14	1042 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	BAD	Q92934	168 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		10.47	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	ATP8B2	P98198	1209 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	WDR78	Q5VTH9	848 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	IDI2	Q9BXS1	227 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		10.46	□□□□□ -0.73
LNX1-208	ENST00000512247	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		10.46	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247		A0A1B0GUL6	1792 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	USP17L5	A8MUK1	530 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	RAB11FIP3	O75154	756 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	GRIN2C	Q14957	1233 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	CEP85	Q6P2H3	762 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	LPIN2	Q92539	896 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	APBA2	Q99767	749 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	FBXO3	Q9UK99	471 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	MUC3A	Q02505	3323 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	AK9	Q5TCS8	1911 aa		10.45	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	DNM1L	O00429	736 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	HERVK_113	P62684	666 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ATP2B2	Q01814	1243 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	MTMR2	Q13614	643 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	GPR142	Q7Z601	462 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	LPAR1	Q92633	364 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	KAZALD1	Q96I82	304 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	PORCN	Q9H237	461 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ABCF2	Q9UG63	623 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		10.44	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	KBTBD13	C9JR72	458 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	SRGAP3	O43295	1099 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	MSC	O60682	206 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	FGFR2	P21802	821 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	BTD	P43251	543 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ERVK-9	P63128	1117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ERVK-24	P63145	666 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247		Q3C1V9	767 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	TRIM60	Q495X7	471 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	SSH3	Q8TE77	659 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ASB2	Q96Q27	587 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		10.43	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	TBC1D12	O60347	775 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	CAP2	P40123	477 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	MAP2K5	Q13163	448 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	MORN1	Q5T089	497 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ANO1	Q5XXA6	986 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	SMC5	Q8IY18	1101 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	USP6NL	Q92738	828 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ZNF576	Q9H609	170 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	DCTPP1	Q9H773	170 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	THEG	Q9P2T0	379 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	CDH23	Q9H251	3354 aa		10.42	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	TTC28	Q96AY4	2481 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	DNAJB2	P25686	324 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	CYP2C19	P33261	490 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	BACE1	P56817	501 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	POLA2	Q14181	598 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	ATP2B3	Q16720	1220 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		10.41	□□□□□ -0.74
LNX1-208	ENST00000512247	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.41	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms