RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 VPS33BQ9H267 617 aa30.36■■■□□ 2.45
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HOXB3-212ENST00000498678 IARSP41252 1262 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 GUCY1B3Q02153 619 aa30.35■■■□□ 2.45
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HOXB3-212ENST00000498678 LARGE2Q8N3Y3 721 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 C8orf76Q96K31 380 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF287Q9HBT7 754 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa30.35■■■□□ 2.45
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HOXB3-212ENST00000498678 CATIPQ7Z7H3 387 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 IL17RBQ9NRM6 502 aa30.35■■■□□ 2.45
HOXB3-212ENST00000498678 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa30.35■■■□□ 2.45
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HOXB3-212ENST00000498678 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa30.34■■■□□ 2.45
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HOXB3-212ENST00000498678 TROAPQ12815 778 aa30.34■■■□□ 2.45
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HOXB3-212ENST00000498678 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
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HOXB3-212ENST00000498678 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa30.32■■■□□ 2.44
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HOXB3-212ENST00000498678 ALG1Q9BT22 464 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXB3-212ENST00000498678 DDAH1O94760 285 aa30.31■■■□□ 2.44
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HOXB3-212ENST00000498678 TSPY8P0CW00 308 aa30.31■■■□□ 2.44
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HOXB3-212ENST00000498678 DGKHQ86XP1 1220 aa30.31■■■□□ 2.44
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HOXB3-212ENST00000498678 CALM1P0DP23 149 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-212ENST00000498678 CALM2P0DP24 149 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXB3-212ENST00000498678 CALM3P0DP25 149 aa30.31■■■□□ 2.44
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HOXB3-212ENST00000498678 KLHL34Q8N239 644 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC82Q8N4S0 544 aa30.27■■■□□ 2.44
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HOXB3-212ENST00000498678 TRIM22Q8IYM9 498 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXB3-212ENST00000498678 NEDD1Q8NHV4 660 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXB3-212ENST00000498678 IDI2Q9BXS1 227 aa30.27■■■□□ 2.44
HOXB3-212ENST00000498678 ZNRF3Q9ULT6 936 aa30.27■■■□□ 2.44
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HOXB3-212ENST00000498678 KAT14Q9H8E8 782 aa30.25■■■□□ 2.43
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HOXB3-212ENST00000498678 ELP1O95163 1332 aa30.24■■■□□ 2.43
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HOXB3-212ENST00000498678 DEXIO95424 95 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 PNMA1Q8ND90 353 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 NPM3O75607 178 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXB3-212ENST00000498678 TMTC3Q6ZXV5 915 aa30.22■■■□□ 2.43
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