RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERC1Q8IUD2 1116 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAPK4P31152 587 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 MTMR2Q13614 643 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRO3102Q9H379 93 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZAP70P43403 619 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 EHD4Q9H223 541 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 PALD1Q9ULE6 856 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 TNNQ9UQP3 1299 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 CYP7A1P22680 504 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 HERVK_113P62684 666 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAP3K12Q12852 859 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 DNAJC18Q9H819 358 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 PDE3AQ14432 1141 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 TTC6Q86TZ1 520 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-207ENST00000497251 USP14P54578 494 aa20.52■□□□□ 0.88
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TRAPPC3-207ENST00000497251 C12orf42Q96LP6 360 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 NBPF3Q9H094 633 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC3-207ENST00000497251 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 MS4A1P11836 297 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP5P45974 858 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERVK-9P63128 1117 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERVK-24P63145 666 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCNA1P78396 465 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-207ENST00000497251 USP17L15C9J2P7 530 aa20.49■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-207ENST00000497251 USP17L11C9JVI0 530 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP17L18D6R9N7 530 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP17L22D6RA61 530 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP17L19D6RCP7 530 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP17L20D6RJB6 530 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 BMP8BP34820 402 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP17L24Q0WX57 530 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 GDF11O95390 407 aa20.48■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-207ENST00000497251 RGS2P41220 211 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 JAG1P78504 1218 aa20.48■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-207ENST00000497251 LBX2Q6XYB7 198 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP6NLQ92738 828 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 CABP5Q9NP86 173 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-207ENST00000497251 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 TRIB2Q92519 343 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 FEZ1Q99689 392 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 SIPA1L1O43166 1804 aa20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 MORN1Q5T089 497 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPR153Q6NV75 609 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPR142Q7Z601 462 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 C11orf49Q9H6J7 331 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 SZT2Q5T011 3432 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 RLBP1P12271 317 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.45■□□□□ 0.86
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