RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 USP6NLQ92738 828 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 IGKV5-2P06315 115 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 FOXK1P85037 733 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 LAPTM4AQ15012 233 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 SNX17Q15036 470 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 MFSD14BQ5SR56 506 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 DCAF15Q66K64 600 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TSPYL6Q8N831 410 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM22K7EJ46 135 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 CSF1RP07333 972 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 CYP2B6P20813 491 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ITGA6P23229 1130 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 SLFN5Q08AF3 891 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TREML2Q5T2D2 321 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TIFAQ96CG3 184 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 CFAP54Q96N23 3096 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC37A2A6NM11 1700 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 H7C1W4 665 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TLL1O43897 1013 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PTPRAP18433 802 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PTPREP23469 700 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 CASP7P55210 303 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 CCL14Q16627 93 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 HOOK2Q96ED9 719 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ZDHHC15Q96MV8 337 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 CD320Q9NPF0 282 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ZHX2Q9Y6X8 837 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TRANK1O15050 2925 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 KCNJ4P48050 445 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 FAM151AQ8WW52 585 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 MRIQ9BWK5 157 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.42□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PRR33A8MZF0 331 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 E9PSI1 815 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PEX10O60683 326 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 IGHA2P01877 340 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 SLURP2P0DP57 97 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 MAP3K10Q02779 954 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM60Q495X7 471 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 TRAF7Q6Q0C0 670 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 SCYL3Q8IZE3 742 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 FBXL18Q96ME1 805 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PHOX2BQ99453 314 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PBX4Q9BYU1 374 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.41□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 DOCK1Q14185 1865 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 GBF1Q92538 1859 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 DNM1LO00429 736 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ERC2O15083 957 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 VAMP4O75379 141 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PPP1R37O75864 691 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 NFIAQ12857 509 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 MORN1Q5T089 497 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 RASIP1Q5U651 963 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.4□□□□□ -0.9
C9orf135-204ENST00000495399 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms